Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET37

Slc5a4a, Solute carrier family 5 member 4A, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4aQ9ET37 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slc5a4aQ9ET37 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slc5a4aQ9ET37 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slc5a4aQ9ET37 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slc5a4aQ9ET37 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slc5a4aQ9ET37 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slc5a4aQ9ET37 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slc5a4aQ9ET37 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slc5a4aQ9ET37 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slc5a4aQ9ET37 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slc5a4aQ9ET37 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Slc5a4aQ9ET37 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Slc5a4aQ9ET37 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Slc5a4aQ9ET37 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Slc5a4aQ9ET37 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Slc5a4aQ9ET37 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Slc5a4aQ9ET37 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Slc5a4aQ9ET37 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Slc5a4aQ9ET37 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Slc5a4aQ9ET37 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Slc5a4aQ9ET37 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Slc5a4aQ9ET37 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Slc5a4aQ9ET37 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Slc5a4aQ9ET37 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Slc5a4aQ9ET37 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Slc5a4aQ9ET37 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Slc5a4aQ9ET37 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Slc5a4aQ9ET37 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Slc5a4aQ9ET37 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Slc5a4aQ9ET37 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Slc5a4aQ9ET37 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Slc5a4aQ9ET37 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Slc5a4aQ9ET37 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Slc5a4aQ9ET37 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Slc5a4aQ9ET37 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Slc5a4aQ9ET37 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Slc5a4aQ9ET37 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Slc5a4aQ9ET37 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slc5a4aQ9ET37 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slc5a4aQ9ET37 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slc5a4aQ9ET37 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slc5a4aQ9ET37 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Slc5a4aQ9ET37 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slc5a4aQ9ET37 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slc5a4aQ9ET37 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slc5a4aQ9ET37 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slc5a4aQ9ET37 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slc5a4aQ9ET37 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Slc5a4aQ9ET37 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slc5a4aQ9ET37 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slc5a4aQ9ET37 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Slc5a4aQ9ET37 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Slc5a4aQ9ET37 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Slc5a4aQ9ET37 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Slc5a4aQ9ET37 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Slc5a4aQ9ET37 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Slc5a4aQ9ET37 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Slc5a4aQ9ET37 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slc5a4aQ9ET37 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slc5a4aQ9ET37 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Slc5a4aQ9ET37 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Slc5a4aQ9ET37 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Slc5a4aQ9ET37 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Slc5a4aQ9ET37 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slc5a4aQ9ET37 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slc5a4aQ9ET37 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Slc5a4aQ9ET37 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Slc5a4aQ9ET37 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Slc5a4aQ9ET37 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Slc5a4aQ9ET37 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Slc5a4aQ9ET37 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Slc5a4aQ9ET37 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Slc5a4aQ9ET37 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Slc5a4aQ9ET37 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Slc5a4aQ9ET37 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Slc5a4aQ9ET37 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Slc5a4aQ9ET37 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Slc5a4aQ9ET37 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Slc5a4aQ9ET37 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Slc5a4aQ9ET37 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Slc5a4aQ9ET37 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Slc5a4aQ9ET37 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Slc5a4aQ9ET37 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Slc5a4aQ9ET37 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Slc5a4aQ9ET37 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Slc5a4aQ9ET37 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Slc5a4aQ9ET37 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Slc5a4aQ9ET37 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Slc5a4aQ9ET37 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Slc5a4aQ9ET37 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Slc5a4aQ9ET37 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Slc5a4aQ9ET37 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Slc5a4aQ9ET37 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Slc5a4aQ9ET37 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Slc5a4aQ9ET37 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Slc5a4aQ9ET37 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Slc5a4aQ9ET37 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slc5a4aQ9ET37 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Slc5a4aQ9ET37 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Slc5a4aQ9ET37 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms