Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Capn12Q9ER56 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Capn12Q9ER56 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Capn12Q9ER56 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Capn12Q9ER56 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Capn12Q9ER56 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Capn12Q9ER56 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Capn12Q9ER56 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Capn12Q9ER56 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Capn12Q9ER56 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Capn12Q9ER56 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Capn12Q9ER56 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Capn12Q9ER56 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Capn12Q9ER56 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Capn12Q9ER56 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Capn12Q9ER56 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Capn12Q9ER56 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Capn12Q9ER56 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Capn12Q9ER56 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Capn12Q9ER56 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Capn12Q9ER56 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Capn12Q9ER56 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Capn12Q9ER56 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Capn12Q9ER56 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Capn12Q9ER56 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Capn12Q9ER56 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Capn12Q9ER56 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Capn12Q9ER56 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Capn12Q9ER56 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Capn12Q9ER56 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Capn12Q9ER56 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Capn12Q9ER56 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Capn12Q9ER56 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Capn12Q9ER56 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Capn12Q9ER56 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Capn12Q9ER56 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Capn12Q9ER56 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Capn12Q9ER56 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Capn12Q9ER56 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Capn12Q9ER56 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Capn12Q9ER56 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Capn12Q9ER56 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Capn12Q9ER56 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Capn12Q9ER56 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Capn12Q9ER56 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Capn12Q9ER56 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Capn12Q9ER56 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Capn12Q9ER56 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Capn12Q9ER56 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Capn12Q9ER56 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Capn12Q9ER56 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Capn12Q9ER56 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Capn12Q9ER56 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Capn12Q9ER56 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Capn12Q9ER56 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Capn12Q9ER56 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Capn12Q9ER56 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Capn12Q9ER56 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Capn12Q9ER56 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Capn12Q9ER56 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Capn12Q9ER56 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Capn12Q9ER56 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Capn12Q9ER56 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Capn12Q9ER56 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Capn12Q9ER56 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Capn12Q9ER56 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Capn12Q9ER56 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Capn12Q9ER56 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Capn12Q9ER56 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Capn12Q9ER56 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Capn12Q9ER56 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Capn12Q9ER56 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Capn12Q9ER56 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Capn12Q9ER56 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Capn12Q9ER56 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Capn12Q9ER56 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Capn12Q9ER56 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Capn12Q9ER56 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Capn12Q9ER56 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Capn12Q9ER56 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Capn12Q9ER56 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Capn12Q9ER56 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Capn12Q9ER56 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Capn12Q9ER56 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Capn12Q9ER56 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Capn12Q9ER56 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Capn12Q9ER56 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Capn12Q9ER56 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Capn12Q9ER56 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Capn12Q9ER56 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Capn12Q9ER56 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Capn12Q9ER56 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Capn12Q9ER56 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Capn12Q9ER56 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Capn12Q9ER56 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Capn12Q9ER56 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Capn12Q9ER56 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Capn12Q9ER56 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Capn12Q9ER56 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Capn12Q9ER56 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms