Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cyp27a1Q9DBG1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cyp27a1Q9DBG1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cyp27a1Q9DBG1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cyp27a1Q9DBG1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cyp27a1Q9DBG1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cyp27a1Q9DBG1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cyp27a1Q9DBG1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cyp27a1Q9DBG1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cyp27a1Q9DBG1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cyp27a1Q9DBG1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cyp27a1Q9DBG1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cyp27a1Q9DBG1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cyp27a1Q9DBG1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Cyp27a1Q9DBG1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cyp27a1Q9DBG1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cyp27a1Q9DBG1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cyp27a1Q9DBG1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cyp27a1Q9DBG1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cyp27a1Q9DBG1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cyp27a1Q9DBG1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cyp27a1Q9DBG1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cyp27a1Q9DBG1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cyp27a1Q9DBG1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cyp27a1Q9DBG1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Cyp27a1Q9DBG1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cyp27a1Q9DBG1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cyp27a1Q9DBG1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cyp27a1Q9DBG1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cyp27a1Q9DBG1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cyp27a1Q9DBG1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cyp27a1Q9DBG1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cyp27a1Q9DBG1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cyp27a1Q9DBG1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cyp27a1Q9DBG1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cyp27a1Q9DBG1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cyp27a1Q9DBG1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cyp27a1Q9DBG1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cyp27a1Q9DBG1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cyp27a1Q9DBG1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cyp27a1Q9DBG1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cyp27a1Q9DBG1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cyp27a1Q9DBG1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cyp27a1Q9DBG1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cyp27a1Q9DBG1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cyp27a1Q9DBG1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cyp27a1Q9DBG1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cyp27a1Q9DBG1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cyp27a1Q9DBG1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cyp27a1Q9DBG1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cyp27a1Q9DBG1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cyp27a1Q9DBG1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cyp27a1Q9DBG1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cyp27a1Q9DBG1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cyp27a1Q9DBG1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cyp27a1Q9DBG1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cyp27a1Q9DBG1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cyp27a1Q9DBG1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cyp27a1Q9DBG1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Cyp27a1Q9DBG1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cyp27a1Q9DBG1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cyp27a1Q9DBG1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cyp27a1Q9DBG1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cyp27a1Q9DBG1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cyp27a1Q9DBG1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cyp27a1Q9DBG1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cyp27a1Q9DBG1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cyp27a1Q9DBG1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cyp27a1Q9DBG1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cyp27a1Q9DBG1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cyp27a1Q9DBG1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cyp27a1Q9DBG1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cyp27a1Q9DBG1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cyp27a1Q9DBG1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cyp27a1Q9DBG1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cyp27a1Q9DBG1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cyp27a1Q9DBG1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cyp27a1Q9DBG1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cyp27a1Q9DBG1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cyp27a1Q9DBG1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cyp27a1Q9DBG1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cyp27a1Q9DBG1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cyp27a1Q9DBG1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cyp27a1Q9DBG1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cyp27a1Q9DBG1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cyp27a1Q9DBG1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cyp27a1Q9DBG1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cyp27a1Q9DBG1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cyp27a1Q9DBG1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cyp27a1Q9DBG1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cyp27a1Q9DBG1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cyp27a1Q9DBG1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cyp27a1Q9DBG1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cyp27a1Q9DBG1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cyp27a1Q9DBG1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cyp27a1Q9DBG1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cyp27a1Q9DBG1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cyp27a1Q9DBG1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cyp27a1Q9DBG1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms