Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC7

Prkar1a, cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkar1aQ9DBC7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkar1aQ9DBC7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkar1aQ9DBC7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkar1aQ9DBC7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkar1aQ9DBC7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkar1aQ9DBC7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkar1aQ9DBC7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkar1aQ9DBC7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkar1aQ9DBC7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkar1aQ9DBC7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prkar1aQ9DBC7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prkar1aQ9DBC7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prkar1aQ9DBC7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prkar1aQ9DBC7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prkar1aQ9DBC7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prkar1aQ9DBC7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Prkar1aQ9DBC7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prkar1aQ9DBC7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prkar1aQ9DBC7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prkar1aQ9DBC7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prkar1aQ9DBC7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prkar1aQ9DBC7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prkar1aQ9DBC7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prkar1aQ9DBC7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prkar1aQ9DBC7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prkar1aQ9DBC7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prkar1aQ9DBC7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prkar1aQ9DBC7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prkar1aQ9DBC7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prkar1aQ9DBC7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prkar1aQ9DBC7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prkar1aQ9DBC7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prkar1aQ9DBC7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prkar1aQ9DBC7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prkar1aQ9DBC7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prkar1aQ9DBC7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prkar1aQ9DBC7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Prkar1aQ9DBC7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prkar1aQ9DBC7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prkar1aQ9DBC7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prkar1aQ9DBC7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prkar1aQ9DBC7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prkar1aQ9DBC7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prkar1aQ9DBC7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prkar1aQ9DBC7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Prkar1aQ9DBC7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prkar1aQ9DBC7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prkar1aQ9DBC7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prkar1aQ9DBC7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prkar1aQ9DBC7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prkar1aQ9DBC7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Prkar1aQ9DBC7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prkar1aQ9DBC7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prkar1aQ9DBC7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prkar1aQ9DBC7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prkar1aQ9DBC7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkar1aQ9DBC7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkar1aQ9DBC7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prkar1aQ9DBC7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Prkar1aQ9DBC7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prkar1aQ9DBC7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prkar1aQ9DBC7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkar1aQ9DBC7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prkar1aQ9DBC7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prkar1aQ9DBC7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkar1aQ9DBC7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkar1aQ9DBC7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkar1aQ9DBC7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkar1aQ9DBC7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkar1aQ9DBC7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prkar1aQ9DBC7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prkar1aQ9DBC7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prkar1aQ9DBC7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prkar1aQ9DBC7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prkar1aQ9DBC7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prkar1aQ9DBC7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prkar1aQ9DBC7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prkar1aQ9DBC7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prkar1aQ9DBC7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prkar1aQ9DBC7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Prkar1aQ9DBC7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prkar1aQ9DBC7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prkar1aQ9DBC7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prkar1aQ9DBC7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prkar1aQ9DBC7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prkar1aQ9DBC7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prkar1aQ9DBC7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prkar1aQ9DBC7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prkar1aQ9DBC7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prkar1aQ9DBC7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prkar1aQ9DBC7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prkar1aQ9DBC7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prkar1aQ9DBC7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prkar1aQ9DBC7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prkar1aQ9DBC7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prkar1aQ9DBC7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prkar1aQ9DBC7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prkar1aQ9DBC7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prkar1aQ9DBC7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prkar1aQ9DBC7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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