Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fundc1Q9DB70 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fundc1Q9DB70 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Fundc1Q9DB70 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fundc1Q9DB70 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fundc1Q9DB70 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fundc1Q9DB70 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fundc1Q9DB70 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fundc1Q9DB70 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fundc1Q9DB70 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fundc1Q9DB70 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fundc1Q9DB70 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fundc1Q9DB70 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fundc1Q9DB70 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fundc1Q9DB70 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Fundc1Q9DB70 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fundc1Q9DB70 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fundc1Q9DB70 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Fundc1Q9DB70 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fundc1Q9DB70 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fundc1Q9DB70 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fundc1Q9DB70 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fundc1Q9DB70 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fundc1Q9DB70 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fundc1Q9DB70 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fundc1Q9DB70 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fundc1Q9DB70 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fundc1Q9DB70 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fundc1Q9DB70 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fundc1Q9DB70 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fundc1Q9DB70 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Fundc1Q9DB70 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Fundc1Q9DB70 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Fundc1Q9DB70 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fundc1Q9DB70 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fundc1Q9DB70 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fundc1Q9DB70 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fundc1Q9DB70 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fundc1Q9DB70 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fundc1Q9DB70 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fundc1Q9DB70 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fundc1Q9DB70 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fundc1Q9DB70 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fundc1Q9DB70 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Fundc1Q9DB70 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fundc1Q9DB70 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fundc1Q9DB70 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fundc1Q9DB70 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fundc1Q9DB70 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fundc1Q9DB70 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Fundc1Q9DB70 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fundc1Q9DB70 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fundc1Q9DB70 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fundc1Q9DB70 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fundc1Q9DB70 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fundc1Q9DB70 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fundc1Q9DB70 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fundc1Q9DB70 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fundc1Q9DB70 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fundc1Q9DB70 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fundc1Q9DB70 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fundc1Q9DB70 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fundc1Q9DB70 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fundc1Q9DB70 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fundc1Q9DB70 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fundc1Q9DB70 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fundc1Q9DB70 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fundc1Q9DB70 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fundc1Q9DB70 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fundc1Q9DB70 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fundc1Q9DB70 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fundc1Q9DB70 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fundc1Q9DB70 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fundc1Q9DB70 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fundc1Q9DB70 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fundc1Q9DB70 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fundc1Q9DB70 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fundc1Q9DB70 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fundc1Q9DB70 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fundc1Q9DB70 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fundc1Q9DB70 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fundc1Q9DB70 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fundc1Q9DB70 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fundc1Q9DB70 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Fundc1Q9DB70 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fundc1Q9DB70 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fundc1Q9DB70 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fundc1Q9DB70 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fundc1Q9DB70 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fundc1Q9DB70 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fundc1Q9DB70 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fundc1Q9DB70 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fundc1Q9DB70 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fundc1Q9DB70 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fundc1Q9DB70 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fundc1Q9DB70 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fundc1Q9DB70 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fundc1Q9DB70 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fundc1Q9DB70 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fundc1Q9DB70 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms