Protein–RNA interactions for Protein: Q9D915

Tcim, Transcriptional and immune response regulator, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TcimQ9D915 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TcimQ9D915 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TcimQ9D915 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TcimQ9D915 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TcimQ9D915 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TcimQ9D915 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TcimQ9D915 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TcimQ9D915 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TcimQ9D915 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TcimQ9D915 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TcimQ9D915 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TcimQ9D915 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TcimQ9D915 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TcimQ9D915 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TcimQ9D915 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TcimQ9D915 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TcimQ9D915 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TcimQ9D915 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TcimQ9D915 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TcimQ9D915 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TcimQ9D915 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TcimQ9D915 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TcimQ9D915 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TcimQ9D915 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TcimQ9D915 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TcimQ9D915 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TcimQ9D915 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TcimQ9D915 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TcimQ9D915 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TcimQ9D915 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TcimQ9D915 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TcimQ9D915 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TcimQ9D915 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TcimQ9D915 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TcimQ9D915 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TcimQ9D915 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TcimQ9D915 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TcimQ9D915 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TcimQ9D915 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TcimQ9D915 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TcimQ9D915 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TcimQ9D915 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TcimQ9D915 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TcimQ9D915 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TcimQ9D915 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TcimQ9D915 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TcimQ9D915 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TcimQ9D915 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TcimQ9D915 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TcimQ9D915 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TcimQ9D915 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TcimQ9D915 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TcimQ9D915 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TcimQ9D915 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TcimQ9D915 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TcimQ9D915 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TcimQ9D915 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TcimQ9D915 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TcimQ9D915 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TcimQ9D915 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TcimQ9D915 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TcimQ9D915 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TcimQ9D915 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TcimQ9D915 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TcimQ9D915 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TcimQ9D915 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TcimQ9D915 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TcimQ9D915 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TcimQ9D915 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TcimQ9D915 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TcimQ9D915 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TcimQ9D915 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TcimQ9D915 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TcimQ9D915 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TcimQ9D915 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TcimQ9D915 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TcimQ9D915 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TcimQ9D915 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TcimQ9D915 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TcimQ9D915 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TcimQ9D915 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TcimQ9D915 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TcimQ9D915 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TcimQ9D915 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TcimQ9D915 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TcimQ9D915 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TcimQ9D915 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TcimQ9D915 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TcimQ9D915 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TcimQ9D915 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TcimQ9D915 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TcimQ9D915 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TcimQ9D915 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TcimQ9D915 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TcimQ9D915 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TcimQ9D915 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TcimQ9D915 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TcimQ9D915 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TcimQ9D915 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TcimQ9D915 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms