Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atg7Q9D906 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atg7Q9D906 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atg7Q9D906 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atg7Q9D906 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atg7Q9D906 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atg7Q9D906 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atg7Q9D906 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atg7Q9D906 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atg7Q9D906 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atg7Q9D906 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atg7Q9D906 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Atg7Q9D906 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atg7Q9D906 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atg7Q9D906 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atg7Q9D906 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atg7Q9D906 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atg7Q9D906 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atg7Q9D906 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atg7Q9D906 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atg7Q9D906 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atg7Q9D906 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Atg7Q9D906 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atg7Q9D906 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atg7Q9D906 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atg7Q9D906 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atg7Q9D906 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Atg7Q9D906 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atg7Q9D906 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atg7Q9D906 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atg7Q9D906 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atg7Q9D906 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atg7Q9D906 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atg7Q9D906 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atg7Q9D906 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atg7Q9D906 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atg7Q9D906 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atg7Q9D906 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Atg7Q9D906 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atg7Q9D906 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atg7Q9D906 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atg7Q9D906 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atg7Q9D906 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atg7Q9D906 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Atg7Q9D906 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atg7Q9D906 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atg7Q9D906 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Atg7Q9D906 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atg7Q9D906 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atg7Q9D906 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atg7Q9D906 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atg7Q9D906 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atg7Q9D906 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atg7Q9D906 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atg7Q9D906 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atg7Q9D906 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atg7Q9D906 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Atg7Q9D906 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Atg7Q9D906 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atg7Q9D906 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atg7Q9D906 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atg7Q9D906 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atg7Q9D906 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Atg7Q9D906 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atg7Q9D906 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atg7Q9D906 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atg7Q9D906 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atg7Q9D906 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atg7Q9D906 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atg7Q9D906 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atg7Q9D906 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atg7Q9D906 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atg7Q9D906 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atg7Q9D906 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atg7Q9D906 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atg7Q9D906 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atg7Q9D906 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atg7Q9D906 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atg7Q9D906 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Atg7Q9D906 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atg7Q9D906 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atg7Q9D906 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atg7Q9D906 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atg7Q9D906 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atg7Q9D906 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atg7Q9D906 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Atg7Q9D906 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atg7Q9D906 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atg7Q9D906 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atg7Q9D906 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atg7Q9D906 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atg7Q9D906 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atg7Q9D906 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atg7Q9D906 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atg7Q9D906 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Atg7Q9D906 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atg7Q9D906 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atg7Q9D906 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atg7Q9D906 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atg7Q9D906 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms