Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx5Q9D8U8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx5Q9D8U8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx5Q9D8U8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx5Q9D8U8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx5Q9D8U8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx5Q9D8U8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx5Q9D8U8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx5Q9D8U8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx5Q9D8U8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx5Q9D8U8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx5Q9D8U8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx5Q9D8U8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx5Q9D8U8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx5Q9D8U8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx5Q9D8U8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx5Q9D8U8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx5Q9D8U8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx5Q9D8U8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx5Q9D8U8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx5Q9D8U8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx5Q9D8U8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx5Q9D8U8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx5Q9D8U8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx5Q9D8U8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx5Q9D8U8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx5Q9D8U8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx5Q9D8U8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx5Q9D8U8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx5Q9D8U8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx5Q9D8U8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx5Q9D8U8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx5Q9D8U8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx5Q9D8U8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx5Q9D8U8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx5Q9D8U8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx5Q9D8U8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx5Q9D8U8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx5Q9D8U8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx5Q9D8U8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx5Q9D8U8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx5Q9D8U8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx5Q9D8U8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx5Q9D8U8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx5Q9D8U8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx5Q9D8U8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx5Q9D8U8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx5Q9D8U8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx5Q9D8U8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx5Q9D8U8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snx5Q9D8U8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx5Q9D8U8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx5Q9D8U8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx5Q9D8U8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx5Q9D8U8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx5Q9D8U8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx5Q9D8U8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx5Q9D8U8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx5Q9D8U8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx5Q9D8U8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx5Q9D8U8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx5Q9D8U8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx5Q9D8U8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx5Q9D8U8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx5Q9D8U8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx5Q9D8U8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx5Q9D8U8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Snx5Q9D8U8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Snx5Q9D8U8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx5Q9D8U8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx5Q9D8U8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx5Q9D8U8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx5Q9D8U8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx5Q9D8U8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx5Q9D8U8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx5Q9D8U8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx5Q9D8U8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx5Q9D8U8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx5Q9D8U8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx5Q9D8U8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx5Q9D8U8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx5Q9D8U8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx5Q9D8U8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx5Q9D8U8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx5Q9D8U8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx5Q9D8U8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx5Q9D8U8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx5Q9D8U8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx5Q9D8U8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx5Q9D8U8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx5Q9D8U8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx5Q9D8U8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx5Q9D8U8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx5Q9D8U8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx5Q9D8U8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx5Q9D8U8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx5Q9D8U8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx5Q9D8U8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx5Q9D8U8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx5Q9D8U8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms