Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W4

Tspan17, Tetraspanin-17, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan17Q9D7W4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tspan17Q9D7W4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tspan17Q9D7W4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Tspan17Q9D7W4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tspan17Q9D7W4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tspan17Q9D7W4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tspan17Q9D7W4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tspan17Q9D7W4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tspan17Q9D7W4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tspan17Q9D7W4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tspan17Q9D7W4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tspan17Q9D7W4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tspan17Q9D7W4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tspan17Q9D7W4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tspan17Q9D7W4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tspan17Q9D7W4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tspan17Q9D7W4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tspan17Q9D7W4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tspan17Q9D7W4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tspan17Q9D7W4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tspan17Q9D7W4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tspan17Q9D7W4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tspan17Q9D7W4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tspan17Q9D7W4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tspan17Q9D7W4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tspan17Q9D7W4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tspan17Q9D7W4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tspan17Q9D7W4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Tspan17Q9D7W4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tspan17Q9D7W4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tspan17Q9D7W4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tspan17Q9D7W4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tspan17Q9D7W4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tspan17Q9D7W4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tspan17Q9D7W4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tspan17Q9D7W4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tspan17Q9D7W4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tspan17Q9D7W4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tspan17Q9D7W4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tspan17Q9D7W4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tspan17Q9D7W4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tspan17Q9D7W4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tspan17Q9D7W4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tspan17Q9D7W4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tspan17Q9D7W4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tspan17Q9D7W4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tspan17Q9D7W4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tspan17Q9D7W4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Tspan17Q9D7W4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tspan17Q9D7W4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tspan17Q9D7W4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Tspan17Q9D7W4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tspan17Q9D7W4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tspan17Q9D7W4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tspan17Q9D7W4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tspan17Q9D7W4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tspan17Q9D7W4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tspan17Q9D7W4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tspan17Q9D7W4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tspan17Q9D7W4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tspan17Q9D7W4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tspan17Q9D7W4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tspan17Q9D7W4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tspan17Q9D7W4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tspan17Q9D7W4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tspan17Q9D7W4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tspan17Q9D7W4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tspan17Q9D7W4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tspan17Q9D7W4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tspan17Q9D7W4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tspan17Q9D7W4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tspan17Q9D7W4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tspan17Q9D7W4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tspan17Q9D7W4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tspan17Q9D7W4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tspan17Q9D7W4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tspan17Q9D7W4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tspan17Q9D7W4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tspan17Q9D7W4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tspan17Q9D7W4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tspan17Q9D7W4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tspan17Q9D7W4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tspan17Q9D7W4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tspan17Q9D7W4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tspan17Q9D7W4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tspan17Q9D7W4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tspan17Q9D7W4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tspan17Q9D7W4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tspan17Q9D7W4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tspan17Q9D7W4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tspan17Q9D7W4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tspan17Q9D7W4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tspan17Q9D7W4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tspan17Q9D7W4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tspan17Q9D7W4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tspan17Q9D7W4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tspan17Q9D7W4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tspan17Q9D7W4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tspan17Q9D7W4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tspan17Q9D7W4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms