Protein–RNA interactions for Protein: Q9D534

Zc2hc1b, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc2hc1bQ9D534 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Zc2hc1bQ9D534 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zc2hc1bQ9D534 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zc2hc1bQ9D534 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zc2hc1bQ9D534 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zc2hc1bQ9D534 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zc2hc1bQ9D534 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zc2hc1bQ9D534 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zc2hc1bQ9D534 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zc2hc1bQ9D534 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zc2hc1bQ9D534 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zc2hc1bQ9D534 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zc2hc1bQ9D534 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zc2hc1bQ9D534 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zc2hc1bQ9D534 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zc2hc1bQ9D534 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zc2hc1bQ9D534 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zc2hc1bQ9D534 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zc2hc1bQ9D534 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zc2hc1bQ9D534 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zc2hc1bQ9D534 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zc2hc1bQ9D534 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zc2hc1bQ9D534 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zc2hc1bQ9D534 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Zc2hc1bQ9D534 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Zc2hc1bQ9D534 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zc2hc1bQ9D534 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Zc2hc1bQ9D534 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Zc2hc1bQ9D534 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zc2hc1bQ9D534 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Zc2hc1bQ9D534 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zc2hc1bQ9D534 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zc2hc1bQ9D534 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zc2hc1bQ9D534 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zc2hc1bQ9D534 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zc2hc1bQ9D534 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zc2hc1bQ9D534 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zc2hc1bQ9D534 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Zc2hc1bQ9D534 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Zc2hc1bQ9D534 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zc2hc1bQ9D534 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zc2hc1bQ9D534 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zc2hc1bQ9D534 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zc2hc1bQ9D534 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zc2hc1bQ9D534 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zc2hc1bQ9D534 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zc2hc1bQ9D534 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zc2hc1bQ9D534 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zc2hc1bQ9D534 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zc2hc1bQ9D534 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Zc2hc1bQ9D534 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zc2hc1bQ9D534 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zc2hc1bQ9D534 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zc2hc1bQ9D534 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Zc2hc1bQ9D534 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zc2hc1bQ9D534 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zc2hc1bQ9D534 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zc2hc1bQ9D534 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zc2hc1bQ9D534 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zc2hc1bQ9D534 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zc2hc1bQ9D534 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zc2hc1bQ9D534 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zc2hc1bQ9D534 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zc2hc1bQ9D534 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zc2hc1bQ9D534 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zc2hc1bQ9D534 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zc2hc1bQ9D534 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zc2hc1bQ9D534 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zc2hc1bQ9D534 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zc2hc1bQ9D534 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zc2hc1bQ9D534 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zc2hc1bQ9D534 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Zc2hc1bQ9D534 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zc2hc1bQ9D534 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zc2hc1bQ9D534 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zc2hc1bQ9D534 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zc2hc1bQ9D534 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zc2hc1bQ9D534 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zc2hc1bQ9D534 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Zc2hc1bQ9D534 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Zc2hc1bQ9D534 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zc2hc1bQ9D534 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zc2hc1bQ9D534 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zc2hc1bQ9D534 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zc2hc1bQ9D534 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zc2hc1bQ9D534 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zc2hc1bQ9D534 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zc2hc1bQ9D534 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zc2hc1bQ9D534 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zc2hc1bQ9D534 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zc2hc1bQ9D534 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zc2hc1bQ9D534 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zc2hc1bQ9D534 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zc2hc1bQ9D534 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zc2hc1bQ9D534 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zc2hc1bQ9D534 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zc2hc1bQ9D534 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zc2hc1bQ9D534 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zc2hc1bQ9D534 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zc2hc1bQ9D534 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms