Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZQ6

Raet1e, Retinoic acid early-inducible protein 1-epsilon, mousemouse

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Length 251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raet1eQ9CZQ6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Raet1eQ9CZQ6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Raet1eQ9CZQ6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Raet1eQ9CZQ6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Raet1eQ9CZQ6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Raet1eQ9CZQ6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Raet1eQ9CZQ6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Raet1eQ9CZQ6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Raet1eQ9CZQ6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Raet1eQ9CZQ6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Raet1eQ9CZQ6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Raet1eQ9CZQ6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Raet1eQ9CZQ6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Raet1eQ9CZQ6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Raet1eQ9CZQ6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Raet1eQ9CZQ6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Raet1eQ9CZQ6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Raet1eQ9CZQ6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Raet1eQ9CZQ6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Raet1eQ9CZQ6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Raet1eQ9CZQ6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Raet1eQ9CZQ6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Raet1eQ9CZQ6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Raet1eQ9CZQ6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Raet1eQ9CZQ6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Raet1eQ9CZQ6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Raet1eQ9CZQ6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Raet1eQ9CZQ6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Raet1eQ9CZQ6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Raet1eQ9CZQ6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Raet1eQ9CZQ6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Raet1eQ9CZQ6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Raet1eQ9CZQ6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Raet1eQ9CZQ6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Raet1eQ9CZQ6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Raet1eQ9CZQ6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Raet1eQ9CZQ6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Raet1eQ9CZQ6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Raet1eQ9CZQ6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Raet1eQ9CZQ6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Raet1eQ9CZQ6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Raet1eQ9CZQ6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Raet1eQ9CZQ6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Raet1eQ9CZQ6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Raet1eQ9CZQ6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Raet1eQ9CZQ6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Raet1eQ9CZQ6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Raet1eQ9CZQ6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Raet1eQ9CZQ6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Raet1eQ9CZQ6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Raet1eQ9CZQ6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Raet1eQ9CZQ6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Raet1eQ9CZQ6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Raet1eQ9CZQ6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Raet1eQ9CZQ6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Raet1eQ9CZQ6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Raet1eQ9CZQ6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Raet1eQ9CZQ6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Raet1eQ9CZQ6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Raet1eQ9CZQ6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Raet1eQ9CZQ6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Raet1eQ9CZQ6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Raet1eQ9CZQ6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Raet1eQ9CZQ6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Raet1eQ9CZQ6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Raet1eQ9CZQ6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Raet1eQ9CZQ6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Raet1eQ9CZQ6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Raet1eQ9CZQ6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Raet1eQ9CZQ6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Raet1eQ9CZQ6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Raet1eQ9CZQ6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Raet1eQ9CZQ6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Raet1eQ9CZQ6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Raet1eQ9CZQ6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Raet1eQ9CZQ6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Raet1eQ9CZQ6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Raet1eQ9CZQ6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Raet1eQ9CZQ6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Raet1eQ9CZQ6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Raet1eQ9CZQ6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Raet1eQ9CZQ6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Raet1eQ9CZQ6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Raet1eQ9CZQ6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Raet1eQ9CZQ6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Raet1eQ9CZQ6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Raet1eQ9CZQ6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Raet1eQ9CZQ6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Raet1eQ9CZQ6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Raet1eQ9CZQ6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Raet1eQ9CZQ6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Raet1eQ9CZQ6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Raet1eQ9CZQ6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Raet1eQ9CZQ6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Raet1eQ9CZQ6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Raet1eQ9CZQ6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Raet1eQ9CZQ6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Raet1eQ9CZQ6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Raet1eQ9CZQ6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Raet1eQ9CZQ6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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