Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Q9CYI0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Q9CYI0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Q9CYI0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Q9CYI0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Q9CYI0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Q9CYI0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Q9CYI0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Q9CYI0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Q9CYI0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Q9CYI0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Q9CYI0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Q9CYI0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Q9CYI0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Q9CYI0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Q9CYI0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Q9CYI0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Q9CYI0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Q9CYI0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Q9CYI0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Q9CYI0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Q9CYI0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Q9CYI0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Q9CYI0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Q9CYI0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Q9CYI0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Q9CYI0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Q9CYI0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Q9CYI0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Q9CYI0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Q9CYI0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Q9CYI0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Q9CYI0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Q9CYI0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Q9CYI0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Q9CYI0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Q9CYI0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Q9CYI0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Q9CYI0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Q9CYI0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Q9CYI0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Q9CYI0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Q9CYI0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Q9CYI0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Q9CYI0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Q9CYI0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Q9CYI0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Q9CYI0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Q9CYI0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Q9CYI0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Q9CYI0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Q9CYI0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Q9CYI0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Q9CYI0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Q9CYI0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Q9CYI0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Q9CYI0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Q9CYI0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Q9CYI0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Q9CYI0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Q9CYI0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Q9CYI0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Q9CYI0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Q9CYI0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Q9CYI0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Q9CYI0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Q9CYI0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Q9CYI0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Q9CYI0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Q9CYI0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Q9CYI0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Q9CYI0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Q9CYI0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Q9CYI0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Q9CYI0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Q9CYI0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Q9CYI0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Q9CYI0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Q9CYI0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Q9CYI0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Q9CYI0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Q9CYI0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Q9CYI0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Q9CYI0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Q9CYI0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Q9CYI0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Q9CYI0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Q9CYI0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Q9CYI0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Q9CYI0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Q9CYI0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Q9CYI0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Q9CYI0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Q9CYI0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Q9CYI0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Q9CYI0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Q9CYI0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Q9CYI0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Q9CYI0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Q9CYI0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms