Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Snx7Q9CY18 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snx7Q9CY18 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snx7Q9CY18 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snx7Q9CY18 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snx7Q9CY18 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snx7Q9CY18 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Snx7Q9CY18 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Snx7Q9CY18 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Snx7Q9CY18 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx7Q9CY18 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx7Q9CY18 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx7Q9CY18 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx7Q9CY18 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx7Q9CY18 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx7Q9CY18 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx7Q9CY18 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Snx7Q9CY18 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snx7Q9CY18 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Snx7Q9CY18 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Snx7Q9CY18 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snx7Q9CY18 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snx7Q9CY18 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snx7Q9CY18 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snx7Q9CY18 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snx7Q9CY18 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snx7Q9CY18 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snx7Q9CY18 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Snx7Q9CY18 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx7Q9CY18 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx7Q9CY18 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx7Q9CY18 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snx7Q9CY18 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx7Q9CY18 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx7Q9CY18 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx7Q9CY18 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx7Q9CY18 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snx7Q9CY18 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snx7Q9CY18 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx7Q9CY18 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx7Q9CY18 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Snx7Q9CY18 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snx7Q9CY18 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx7Q9CY18 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx7Q9CY18 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx7Q9CY18 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snx7Q9CY18 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snx7Q9CY18 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snx7Q9CY18 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snx7Q9CY18 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snx7Q9CY18 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx7Q9CY18 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx7Q9CY18 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx7Q9CY18 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx7Q9CY18 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx7Q9CY18 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx7Q9CY18 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx7Q9CY18 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snx7Q9CY18 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snx7Q9CY18 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snx7Q9CY18 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snx7Q9CY18 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snx7Q9CY18 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snx7Q9CY18 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snx7Q9CY18 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snx7Q9CY18 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx7Q9CY18 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx7Q9CY18 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx7Q9CY18 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx7Q9CY18 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx7Q9CY18 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snx7Q9CY18 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snx7Q9CY18 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snx7Q9CY18 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snx7Q9CY18 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snx7Q9CY18 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snx7Q9CY18 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snx7Q9CY18 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snx7Q9CY18 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snx7Q9CY18 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx7Q9CY18 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx7Q9CY18 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx7Q9CY18 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx7Q9CY18 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx7Q9CY18 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx7Q9CY18 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx7Q9CY18 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snx7Q9CY18 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snx7Q9CY18 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snx7Q9CY18 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snx7Q9CY18 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snx7Q9CY18 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snx7Q9CY18 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Snx7Q9CY18 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snx7Q9CY18 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snx7Q9CY18 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx7Q9CY18 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx7Q9CY18 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx7Q9CY18 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx7Q9CY18 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms