Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXB8

Alpk1, Alpha-protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk1Q9CXB8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Alpk1Q9CXB8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Alpk1Q9CXB8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Alpk1Q9CXB8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Alpk1Q9CXB8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Alpk1Q9CXB8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Alpk1Q9CXB8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Alpk1Q9CXB8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Alpk1Q9CXB8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Alpk1Q9CXB8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Alpk1Q9CXB8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Alpk1Q9CXB8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Alpk1Q9CXB8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Alpk1Q9CXB8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Alpk1Q9CXB8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Alpk1Q9CXB8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Alpk1Q9CXB8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Alpk1Q9CXB8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Alpk1Q9CXB8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Alpk1Q9CXB8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Alpk1Q9CXB8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Alpk1Q9CXB8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Alpk1Q9CXB8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Alpk1Q9CXB8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Alpk1Q9CXB8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Alpk1Q9CXB8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Alpk1Q9CXB8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Alpk1Q9CXB8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Alpk1Q9CXB8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Alpk1Q9CXB8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Alpk1Q9CXB8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Alpk1Q9CXB8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Alpk1Q9CXB8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Alpk1Q9CXB8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Alpk1Q9CXB8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Alpk1Q9CXB8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Alpk1Q9CXB8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Alpk1Q9CXB8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Alpk1Q9CXB8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Alpk1Q9CXB8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Alpk1Q9CXB8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Alpk1Q9CXB8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Alpk1Q9CXB8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Alpk1Q9CXB8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Alpk1Q9CXB8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Alpk1Q9CXB8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Alpk1Q9CXB8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Alpk1Q9CXB8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Alpk1Q9CXB8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Alpk1Q9CXB8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Alpk1Q9CXB8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Alpk1Q9CXB8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Alpk1Q9CXB8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Alpk1Q9CXB8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Alpk1Q9CXB8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Alpk1Q9CXB8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Alpk1Q9CXB8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Alpk1Q9CXB8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Alpk1Q9CXB8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Alpk1Q9CXB8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Alpk1Q9CXB8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Alpk1Q9CXB8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Alpk1Q9CXB8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Alpk1Q9CXB8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Alpk1Q9CXB8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Alpk1Q9CXB8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Alpk1Q9CXB8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Alpk1Q9CXB8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Alpk1Q9CXB8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Alpk1Q9CXB8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Alpk1Q9CXB8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Alpk1Q9CXB8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Alpk1Q9CXB8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Alpk1Q9CXB8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Alpk1Q9CXB8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Alpk1Q9CXB8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Alpk1Q9CXB8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Alpk1Q9CXB8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Alpk1Q9CXB8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Alpk1Q9CXB8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Alpk1Q9CXB8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Alpk1Q9CXB8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Alpk1Q9CXB8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Alpk1Q9CXB8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Alpk1Q9CXB8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Alpk1Q9CXB8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Alpk1Q9CXB8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Alpk1Q9CXB8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Alpk1Q9CXB8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Alpk1Q9CXB8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Alpk1Q9CXB8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Alpk1Q9CXB8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Alpk1Q9CXB8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Alpk1Q9CXB8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Alpk1Q9CXB8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Alpk1Q9CXB8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Alpk1Q9CXB8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Alpk1Q9CXB8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Alpk1Q9CXB8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Alpk1Q9CXB8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms