Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXB8

Alpk1, Alpha-protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk1Q9CXB8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Alpk1Q9CXB8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Alpk1Q9CXB8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Alpk1Q9CXB8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Alpk1Q9CXB8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Alpk1Q9CXB8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Alpk1Q9CXB8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Alpk1Q9CXB8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Alpk1Q9CXB8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Alpk1Q9CXB8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Alpk1Q9CXB8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Alpk1Q9CXB8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Alpk1Q9CXB8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Alpk1Q9CXB8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Alpk1Q9CXB8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Alpk1Q9CXB8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Alpk1Q9CXB8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Alpk1Q9CXB8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Alpk1Q9CXB8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Alpk1Q9CXB8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Alpk1Q9CXB8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Alpk1Q9CXB8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Alpk1Q9CXB8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Alpk1Q9CXB8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Alpk1Q9CXB8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Alpk1Q9CXB8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Alpk1Q9CXB8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Alpk1Q9CXB8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Alpk1Q9CXB8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Alpk1Q9CXB8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Alpk1Q9CXB8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Alpk1Q9CXB8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Alpk1Q9CXB8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Alpk1Q9CXB8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Alpk1Q9CXB8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Alpk1Q9CXB8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Alpk1Q9CXB8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Alpk1Q9CXB8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Alpk1Q9CXB8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Alpk1Q9CXB8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Alpk1Q9CXB8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Alpk1Q9CXB8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Alpk1Q9CXB8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Alpk1Q9CXB8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Alpk1Q9CXB8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Alpk1Q9CXB8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Alpk1Q9CXB8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Alpk1Q9CXB8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Alpk1Q9CXB8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Alpk1Q9CXB8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Alpk1Q9CXB8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Alpk1Q9CXB8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Alpk1Q9CXB8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Alpk1Q9CXB8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Alpk1Q9CXB8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Alpk1Q9CXB8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Alpk1Q9CXB8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Alpk1Q9CXB8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Alpk1Q9CXB8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Alpk1Q9CXB8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Alpk1Q9CXB8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Alpk1Q9CXB8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Alpk1Q9CXB8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Alpk1Q9CXB8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Alpk1Q9CXB8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Alpk1Q9CXB8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Alpk1Q9CXB8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Alpk1Q9CXB8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Alpk1Q9CXB8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Alpk1Q9CXB8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Alpk1Q9CXB8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Alpk1Q9CXB8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Alpk1Q9CXB8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Alpk1Q9CXB8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Alpk1Q9CXB8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Alpk1Q9CXB8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Alpk1Q9CXB8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Alpk1Q9CXB8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Alpk1Q9CXB8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Alpk1Q9CXB8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Alpk1Q9CXB8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Alpk1Q9CXB8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Alpk1Q9CXB8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Alpk1Q9CXB8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Alpk1Q9CXB8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Alpk1Q9CXB8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Alpk1Q9CXB8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Alpk1Q9CXB8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Alpk1Q9CXB8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Alpk1Q9CXB8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Alpk1Q9CXB8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Alpk1Q9CXB8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Alpk1Q9CXB8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Alpk1Q9CXB8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Alpk1Q9CXB8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Alpk1Q9CXB8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Alpk1Q9CXB8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Alpk1Q9CXB8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Alpk1Q9CXB8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Alpk1Q9CXB8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms