Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX00

Ist1, IST1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ist1Q9CX00 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ist1Q9CX00 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ist1Q9CX00 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ist1Q9CX00 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ist1Q9CX00 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ist1Q9CX00 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ist1Q9CX00 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ist1Q9CX00 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ist1Q9CX00 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ist1Q9CX00 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ist1Q9CX00 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ist1Q9CX00 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Ist1Q9CX00 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ist1Q9CX00 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ist1Q9CX00 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ist1Q9CX00 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ist1Q9CX00 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ist1Q9CX00 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ist1Q9CX00 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ist1Q9CX00 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ist1Q9CX00 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ist1Q9CX00 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ist1Q9CX00 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ist1Q9CX00 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ist1Q9CX00 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ist1Q9CX00 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ist1Q9CX00 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ist1Q9CX00 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ist1Q9CX00 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ist1Q9CX00 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ist1Q9CX00 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ist1Q9CX00 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ist1Q9CX00 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ist1Q9CX00 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ist1Q9CX00 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ist1Q9CX00 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ist1Q9CX00 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ist1Q9CX00 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ist1Q9CX00 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ist1Q9CX00 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ist1Q9CX00 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ist1Q9CX00 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ist1Q9CX00 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ist1Q9CX00 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ist1Q9CX00 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ist1Q9CX00 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ist1Q9CX00 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ist1Q9CX00 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ist1Q9CX00 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ist1Q9CX00 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ist1Q9CX00 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ist1Q9CX00 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ist1Q9CX00 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ist1Q9CX00 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ist1Q9CX00 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ist1Q9CX00 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ist1Q9CX00 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ist1Q9CX00 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ist1Q9CX00 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ist1Q9CX00 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ist1Q9CX00 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ist1Q9CX00 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ist1Q9CX00 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ist1Q9CX00 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ist1Q9CX00 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ist1Q9CX00 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ist1Q9CX00 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ist1Q9CX00 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ist1Q9CX00 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ist1Q9CX00 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ist1Q9CX00 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ist1Q9CX00 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ist1Q9CX00 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ist1Q9CX00 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ist1Q9CX00 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ist1Q9CX00 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ist1Q9CX00 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ist1Q9CX00 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ist1Q9CX00 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ist1Q9CX00 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ist1Q9CX00 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ist1Q9CX00 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ist1Q9CX00 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ist1Q9CX00 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ist1Q9CX00 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ist1Q9CX00 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ist1Q9CX00 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ist1Q9CX00 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ist1Q9CX00 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ist1Q9CX00 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ist1Q9CX00 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ist1Q9CX00 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ist1Q9CX00 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ist1Q9CX00 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ist1Q9CX00 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ist1Q9CX00 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ist1Q9CX00 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ist1Q9CX00 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ist1Q9CX00 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ist1Q9CX00 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms