Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RpainQ9CWY9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RpainQ9CWY9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RpainQ9CWY9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RpainQ9CWY9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RpainQ9CWY9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RpainQ9CWY9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RpainQ9CWY9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RpainQ9CWY9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RpainQ9CWY9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RpainQ9CWY9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RpainQ9CWY9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RpainQ9CWY9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RpainQ9CWY9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RpainQ9CWY9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RpainQ9CWY9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RpainQ9CWY9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RpainQ9CWY9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RpainQ9CWY9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RpainQ9CWY9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RpainQ9CWY9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RpainQ9CWY9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RpainQ9CWY9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RpainQ9CWY9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RpainQ9CWY9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RpainQ9CWY9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RpainQ9CWY9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RpainQ9CWY9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RpainQ9CWY9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RpainQ9CWY9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RpainQ9CWY9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RpainQ9CWY9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RpainQ9CWY9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RpainQ9CWY9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RpainQ9CWY9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RpainQ9CWY9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RpainQ9CWY9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RpainQ9CWY9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RpainQ9CWY9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RpainQ9CWY9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RpainQ9CWY9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RpainQ9CWY9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RpainQ9CWY9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RpainQ9CWY9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RpainQ9CWY9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RpainQ9CWY9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RpainQ9CWY9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RpainQ9CWY9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RpainQ9CWY9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RpainQ9CWY9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RpainQ9CWY9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RpainQ9CWY9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RpainQ9CWY9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RpainQ9CWY9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RpainQ9CWY9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RpainQ9CWY9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RpainQ9CWY9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RpainQ9CWY9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RpainQ9CWY9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RpainQ9CWY9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RpainQ9CWY9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RpainQ9CWY9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RpainQ9CWY9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RpainQ9CWY9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RpainQ9CWY9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RpainQ9CWY9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RpainQ9CWY9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RpainQ9CWY9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RpainQ9CWY9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RpainQ9CWY9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RpainQ9CWY9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RpainQ9CWY9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RpainQ9CWY9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RpainQ9CWY9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RpainQ9CWY9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RpainQ9CWY9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RpainQ9CWY9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RpainQ9CWY9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RpainQ9CWY9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RpainQ9CWY9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RpainQ9CWY9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RpainQ9CWY9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RpainQ9CWY9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RpainQ9CWY9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RpainQ9CWY9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RpainQ9CWY9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RpainQ9CWY9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RpainQ9CWY9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RpainQ9CWY9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RpainQ9CWY9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RpainQ9CWY9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RpainQ9CWY9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RpainQ9CWY9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RpainQ9CWY9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RpainQ9CWY9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RpainQ9CWY9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RpainQ9CWY9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RpainQ9CWY9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RpainQ9CWY9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RpainQ9CWY9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms