Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ20

Mid1ip1, Mid1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1ip1Q9CQ20 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mid1ip1Q9CQ20 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mid1ip1Q9CQ20 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mid1ip1Q9CQ20 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Mid1ip1Q9CQ20 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Mid1ip1Q9CQ20 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mid1ip1Q9CQ20 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mid1ip1Q9CQ20 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mid1ip1Q9CQ20 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mid1ip1Q9CQ20 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mid1ip1Q9CQ20 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Mid1ip1Q9CQ20 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mid1ip1Q9CQ20 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mid1ip1Q9CQ20 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mid1ip1Q9CQ20 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mid1ip1Q9CQ20 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mid1ip1Q9CQ20 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mid1ip1Q9CQ20 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mid1ip1Q9CQ20 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mid1ip1Q9CQ20 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mid1ip1Q9CQ20 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mid1ip1Q9CQ20 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mid1ip1Q9CQ20 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mid1ip1Q9CQ20 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mid1ip1Q9CQ20 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mid1ip1Q9CQ20 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Mid1ip1Q9CQ20 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mid1ip1Q9CQ20 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mid1ip1Q9CQ20 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Mid1ip1Q9CQ20 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mid1ip1Q9CQ20 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mid1ip1Q9CQ20 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mid1ip1Q9CQ20 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mid1ip1Q9CQ20 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mid1ip1Q9CQ20 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mid1ip1Q9CQ20 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mid1ip1Q9CQ20 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mid1ip1Q9CQ20 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mid1ip1Q9CQ20 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mid1ip1Q9CQ20 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mid1ip1Q9CQ20 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mid1ip1Q9CQ20 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mid1ip1Q9CQ20 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mid1ip1Q9CQ20 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mid1ip1Q9CQ20 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mid1ip1Q9CQ20 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mid1ip1Q9CQ20 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mid1ip1Q9CQ20 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mid1ip1Q9CQ20 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mid1ip1Q9CQ20 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mid1ip1Q9CQ20 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mid1ip1Q9CQ20 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mid1ip1Q9CQ20 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mid1ip1Q9CQ20 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Mid1ip1Q9CQ20 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mid1ip1Q9CQ20 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mid1ip1Q9CQ20 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mid1ip1Q9CQ20 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mid1ip1Q9CQ20 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mid1ip1Q9CQ20 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Mid1ip1Q9CQ20 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mid1ip1Q9CQ20 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mid1ip1Q9CQ20 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mid1ip1Q9CQ20 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mid1ip1Q9CQ20 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mid1ip1Q9CQ20 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mid1ip1Q9CQ20 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mid1ip1Q9CQ20 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mid1ip1Q9CQ20 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mid1ip1Q9CQ20 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mid1ip1Q9CQ20 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Mid1ip1Q9CQ20 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mid1ip1Q9CQ20 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Mid1ip1Q9CQ20 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mid1ip1Q9CQ20 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mid1ip1Q9CQ20 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mid1ip1Q9CQ20 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Mid1ip1Q9CQ20 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mid1ip1Q9CQ20 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mid1ip1Q9CQ20 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mid1ip1Q9CQ20 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mid1ip1Q9CQ20 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mid1ip1Q9CQ20 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mid1ip1Q9CQ20 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mid1ip1Q9CQ20 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mid1ip1Q9CQ20 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mid1ip1Q9CQ20 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mid1ip1Q9CQ20 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mid1ip1Q9CQ20 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mid1ip1Q9CQ20 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mid1ip1Q9CQ20 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mid1ip1Q9CQ20 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mid1ip1Q9CQ20 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mid1ip1Q9CQ20 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mid1ip1Q9CQ20 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mid1ip1Q9CQ20 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mid1ip1Q9CQ20 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mid1ip1Q9CQ20 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms