Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Csmd1Q923L3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Csmd1Q923L3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Csmd1Q923L3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Csmd1Q923L3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Csmd1Q923L3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Csmd1Q923L3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Csmd1Q923L3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Csmd1Q923L3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Csmd1Q923L3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Csmd1Q923L3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Csmd1Q923L3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Csmd1Q923L3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csmd1Q923L3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csmd1Q923L3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csmd1Q923L3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csmd1Q923L3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csmd1Q923L3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csmd1Q923L3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csmd1Q923L3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csmd1Q923L3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csmd1Q923L3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csmd1Q923L3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csmd1Q923L3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csmd1Q923L3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csmd1Q923L3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csmd1Q923L3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csmd1Q923L3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csmd1Q923L3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csmd1Q923L3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csmd1Q923L3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csmd1Q923L3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csmd1Q923L3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csmd1Q923L3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csmd1Q923L3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csmd1Q923L3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csmd1Q923L3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csmd1Q923L3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csmd1Q923L3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csmd1Q923L3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csmd1Q923L3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csmd1Q923L3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csmd1Q923L3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csmd1Q923L3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csmd1Q923L3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Csmd1Q923L3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Csmd1Q923L3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csmd1Q923L3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csmd1Q923L3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Csmd1Q923L3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Csmd1Q923L3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csmd1Q923L3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csmd1Q923L3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csmd1Q923L3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csmd1Q923L3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csmd1Q923L3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csmd1Q923L3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csmd1Q923L3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csmd1Q923L3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csmd1Q923L3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csmd1Q923L3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csmd1Q923L3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csmd1Q923L3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csmd1Q923L3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csmd1Q923L3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csmd1Q923L3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csmd1Q923L3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Csmd1Q923L3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Csmd1Q923L3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csmd1Q923L3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csmd1Q923L3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csmd1Q923L3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csmd1Q923L3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csmd1Q923L3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csmd1Q923L3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csmd1Q923L3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csmd1Q923L3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csmd1Q923L3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csmd1Q923L3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csmd1Q923L3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Csmd1Q923L3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csmd1Q923L3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csmd1Q923L3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csmd1Q923L3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csmd1Q923L3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csmd1Q923L3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csmd1Q923L3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csmd1Q923L3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csmd1Q923L3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csmd1Q923L3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csmd1Q923L3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csmd1Q923L3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csmd1Q923L3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csmd1Q923L3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csmd1Q923L3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csmd1Q923L3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csmd1Q923L3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csmd1Q923L3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csmd1Q923L3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csmd1Q923L3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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