Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y13

Pcdha7, Protocadherin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha7Q91Y13 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pcdha7Q91Y13 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pcdha7Q91Y13 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pcdha7Q91Y13 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pcdha7Q91Y13 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pcdha7Q91Y13 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pcdha7Q91Y13 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pcdha7Q91Y13 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pcdha7Q91Y13 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Pcdha7Q91Y13 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pcdha7Q91Y13 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pcdha7Q91Y13 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pcdha7Q91Y13 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pcdha7Q91Y13 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pcdha7Q91Y13 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Pcdha7Q91Y13 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pcdha7Q91Y13 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Pcdha7Q91Y13 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pcdha7Q91Y13 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pcdha7Q91Y13 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pcdha7Q91Y13 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pcdha7Q91Y13 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pcdha7Q91Y13 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pcdha7Q91Y13 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pcdha7Q91Y13 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pcdha7Q91Y13 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pcdha7Q91Y13 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Pcdha7Q91Y13 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pcdha7Q91Y13 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pcdha7Q91Y13 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pcdha7Q91Y13 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pcdha7Q91Y13 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pcdha7Q91Y13 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Pcdha7Q91Y13 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pcdha7Q91Y13 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pcdha7Q91Y13 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pcdha7Q91Y13 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pcdha7Q91Y13 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pcdha7Q91Y13 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pcdha7Q91Y13 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pcdha7Q91Y13 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pcdha7Q91Y13 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pcdha7Q91Y13 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pcdha7Q91Y13 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pcdha7Q91Y13 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pcdha7Q91Y13 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pcdha7Q91Y13 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pcdha7Q91Y13 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pcdha7Q91Y13 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pcdha7Q91Y13 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pcdha7Q91Y13 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pcdha7Q91Y13 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pcdha7Q91Y13 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pcdha7Q91Y13 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pcdha7Q91Y13 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pcdha7Q91Y13 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pcdha7Q91Y13 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pcdha7Q91Y13 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Pcdha7Q91Y13 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Pcdha7Q91Y13 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pcdha7Q91Y13 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pcdha7Q91Y13 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pcdha7Q91Y13 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pcdha7Q91Y13 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pcdha7Q91Y13 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pcdha7Q91Y13 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pcdha7Q91Y13 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pcdha7Q91Y13 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Pcdha7Q91Y13 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pcdha7Q91Y13 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pcdha7Q91Y13 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pcdha7Q91Y13 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pcdha7Q91Y13 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pcdha7Q91Y13 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pcdha7Q91Y13 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pcdha7Q91Y13 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pcdha7Q91Y13 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pcdha7Q91Y13 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pcdha7Q91Y13 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pcdha7Q91Y13 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pcdha7Q91Y13 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pcdha7Q91Y13 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pcdha7Q91Y13 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pcdha7Q91Y13 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pcdha7Q91Y13 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pcdha7Q91Y13 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pcdha7Q91Y13 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pcdha7Q91Y13 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pcdha7Q91Y13 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pcdha7Q91Y13 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pcdha7Q91Y13 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pcdha7Q91Y13 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pcdha7Q91Y13 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pcdha7Q91Y13 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pcdha7Q91Y13 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pcdha7Q91Y13 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pcdha7Q91Y13 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pcdha7Q91Y13 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pcdha7Q91Y13 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pcdha7Q91Y13 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms