Protein–RNA interactions for Protein: Q91XT4

Sec16b, Protein transport protein Sec16B, mousemouse

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec16bQ91XT4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sec16bQ91XT4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sec16bQ91XT4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sec16bQ91XT4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sec16bQ91XT4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sec16bQ91XT4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sec16bQ91XT4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sec16bQ91XT4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sec16bQ91XT4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sec16bQ91XT4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sec16bQ91XT4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sec16bQ91XT4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sec16bQ91XT4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sec16bQ91XT4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sec16bQ91XT4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sec16bQ91XT4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sec16bQ91XT4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sec16bQ91XT4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sec16bQ91XT4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sec16bQ91XT4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sec16bQ91XT4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sec16bQ91XT4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Sec16bQ91XT4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sec16bQ91XT4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sec16bQ91XT4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sec16bQ91XT4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sec16bQ91XT4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sec16bQ91XT4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sec16bQ91XT4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sec16bQ91XT4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sec16bQ91XT4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sec16bQ91XT4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sec16bQ91XT4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sec16bQ91XT4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sec16bQ91XT4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sec16bQ91XT4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sec16bQ91XT4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sec16bQ91XT4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sec16bQ91XT4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sec16bQ91XT4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sec16bQ91XT4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sec16bQ91XT4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sec16bQ91XT4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sec16bQ91XT4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sec16bQ91XT4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sec16bQ91XT4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sec16bQ91XT4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sec16bQ91XT4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sec16bQ91XT4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sec16bQ91XT4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sec16bQ91XT4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sec16bQ91XT4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sec16bQ91XT4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sec16bQ91XT4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sec16bQ91XT4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sec16bQ91XT4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sec16bQ91XT4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sec16bQ91XT4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sec16bQ91XT4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sec16bQ91XT4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sec16bQ91XT4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sec16bQ91XT4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sec16bQ91XT4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sec16bQ91XT4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sec16bQ91XT4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sec16bQ91XT4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sec16bQ91XT4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Sec16bQ91XT4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sec16bQ91XT4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sec16bQ91XT4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sec16bQ91XT4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sec16bQ91XT4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sec16bQ91XT4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sec16bQ91XT4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sec16bQ91XT4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sec16bQ91XT4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sec16bQ91XT4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sec16bQ91XT4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sec16bQ91XT4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sec16bQ91XT4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sec16bQ91XT4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sec16bQ91XT4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sec16bQ91XT4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sec16bQ91XT4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sec16bQ91XT4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sec16bQ91XT4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sec16bQ91XT4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sec16bQ91XT4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sec16bQ91XT4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sec16bQ91XT4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sec16bQ91XT4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sec16bQ91XT4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sec16bQ91XT4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sec16bQ91XT4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sec16bQ91XT4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sec16bQ91XT4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sec16bQ91XT4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sec16bQ91XT4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sec16bQ91XT4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sec16bQ91XT4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms