Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sh3bgrl3Q91VW3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sh3bgrl3Q91VW3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sh3bgrl3Q91VW3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bgrl3Q91VW3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bgrl3Q91VW3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sh3bgrl3Q91VW3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bgrl3Q91VW3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bgrl3Q91VW3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bgrl3Q91VW3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bgrl3Q91VW3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bgrl3Q91VW3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bgrl3Q91VW3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bgrl3Q91VW3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bgrl3Q91VW3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sh3bgrl3Q91VW3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bgrl3Q91VW3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bgrl3Q91VW3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bgrl3Q91VW3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bgrl3Q91VW3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bgrl3Q91VW3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bgrl3Q91VW3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bgrl3Q91VW3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bgrl3Q91VW3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bgrl3Q91VW3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bgrl3Q91VW3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bgrl3Q91VW3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bgrl3Q91VW3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bgrl3Q91VW3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sh3bgrl3Q91VW3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3bgrl3Q91VW3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3bgrl3Q91VW3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3bgrl3Q91VW3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bgrl3Q91VW3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bgrl3Q91VW3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bgrl3Q91VW3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bgrl3Q91VW3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bgrl3Q91VW3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bgrl3Q91VW3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bgrl3Q91VW3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bgrl3Q91VW3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bgrl3Q91VW3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bgrl3Q91VW3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3bgrl3Q91VW3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh3bgrl3Q91VW3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3bgrl3Q91VW3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3bgrl3Q91VW3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sh3bgrl3Q91VW3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3bgrl3Q91VW3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bgrl3Q91VW3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bgrl3Q91VW3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bgrl3Q91VW3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bgrl3Q91VW3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3bgrl3Q91VW3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3bgrl3Q91VW3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3bgrl3Q91VW3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh3bgrl3Q91VW3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh3bgrl3Q91VW3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh3bgrl3Q91VW3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bgrl3Q91VW3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bgrl3Q91VW3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bgrl3Q91VW3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bgrl3Q91VW3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bgrl3Q91VW3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms