Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE4

Rpa1, Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa1Q8VEE4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rpa1Q8VEE4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rpa1Q8VEE4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpa1Q8VEE4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpa1Q8VEE4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpa1Q8VEE4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rpa1Q8VEE4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rpa1Q8VEE4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rpa1Q8VEE4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpa1Q8VEE4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpa1Q8VEE4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpa1Q8VEE4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpa1Q8VEE4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpa1Q8VEE4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpa1Q8VEE4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rpa1Q8VEE4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rpa1Q8VEE4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rpa1Q8VEE4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rpa1Q8VEE4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rpa1Q8VEE4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Rpa1Q8VEE4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rpa1Q8VEE4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rpa1Q8VEE4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rpa1Q8VEE4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rpa1Q8VEE4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rpa1Q8VEE4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rpa1Q8VEE4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rpa1Q8VEE4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rpa1Q8VEE4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rpa1Q8VEE4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rpa1Q8VEE4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rpa1Q8VEE4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rpa1Q8VEE4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rpa1Q8VEE4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rpa1Q8VEE4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rpa1Q8VEE4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rpa1Q8VEE4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rpa1Q8VEE4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rpa1Q8VEE4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rpa1Q8VEE4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rpa1Q8VEE4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rpa1Q8VEE4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rpa1Q8VEE4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rpa1Q8VEE4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rpa1Q8VEE4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rpa1Q8VEE4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpa1Q8VEE4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpa1Q8VEE4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpa1Q8VEE4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpa1Q8VEE4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpa1Q8VEE4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rpa1Q8VEE4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rpa1Q8VEE4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rpa1Q8VEE4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rpa1Q8VEE4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpa1Q8VEE4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpa1Q8VEE4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpa1Q8VEE4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpa1Q8VEE4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpa1Q8VEE4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpa1Q8VEE4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpa1Q8VEE4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpa1Q8VEE4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpa1Q8VEE4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpa1Q8VEE4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpa1Q8VEE4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpa1Q8VEE4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpa1Q8VEE4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpa1Q8VEE4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rpa1Q8VEE4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rpa1Q8VEE4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rpa1Q8VEE4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rpa1Q8VEE4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rpa1Q8VEE4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rpa1Q8VEE4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Rpa1Q8VEE4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpa1Q8VEE4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpa1Q8VEE4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpa1Q8VEE4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpa1Q8VEE4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpa1Q8VEE4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpa1Q8VEE4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rpa1Q8VEE4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rpa1Q8VEE4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rpa1Q8VEE4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rpa1Q8VEE4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpa1Q8VEE4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpa1Q8VEE4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpa1Q8VEE4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpa1Q8VEE4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpa1Q8VEE4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpa1Q8VEE4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpa1Q8VEE4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpa1Q8VEE4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpa1Q8VEE4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpa1Q8VEE4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpa1Q8VEE4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpa1Q8VEE4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rpa1Q8VEE4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rpa1Q8VEE4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms