Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1U1

Cog4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog4Q8R1U1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cog4Q8R1U1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cog4Q8R1U1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cog4Q8R1U1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cog4Q8R1U1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cog4Q8R1U1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cog4Q8R1U1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cog4Q8R1U1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cog4Q8R1U1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cog4Q8R1U1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cog4Q8R1U1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cog4Q8R1U1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cog4Q8R1U1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cog4Q8R1U1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cog4Q8R1U1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cog4Q8R1U1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cog4Q8R1U1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cog4Q8R1U1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cog4Q8R1U1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cog4Q8R1U1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cog4Q8R1U1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cog4Q8R1U1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cog4Q8R1U1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cog4Q8R1U1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cog4Q8R1U1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cog4Q8R1U1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cog4Q8R1U1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cog4Q8R1U1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cog4Q8R1U1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cog4Q8R1U1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cog4Q8R1U1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cog4Q8R1U1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cog4Q8R1U1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cog4Q8R1U1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cog4Q8R1U1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cog4Q8R1U1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cog4Q8R1U1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cog4Q8R1U1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cog4Q8R1U1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cog4Q8R1U1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cog4Q8R1U1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cog4Q8R1U1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cog4Q8R1U1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cog4Q8R1U1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cog4Q8R1U1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cog4Q8R1U1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cog4Q8R1U1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cog4Q8R1U1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cog4Q8R1U1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cog4Q8R1U1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cog4Q8R1U1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cog4Q8R1U1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cog4Q8R1U1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cog4Q8R1U1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cog4Q8R1U1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cog4Q8R1U1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cog4Q8R1U1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cog4Q8R1U1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cog4Q8R1U1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cog4Q8R1U1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cog4Q8R1U1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cog4Q8R1U1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cog4Q8R1U1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cog4Q8R1U1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cog4Q8R1U1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cog4Q8R1U1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cog4Q8R1U1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cog4Q8R1U1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cog4Q8R1U1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cog4Q8R1U1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cog4Q8R1U1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cog4Q8R1U1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cog4Q8R1U1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cog4Q8R1U1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cog4Q8R1U1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cog4Q8R1U1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cog4Q8R1U1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cog4Q8R1U1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cog4Q8R1U1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cog4Q8R1U1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cog4Q8R1U1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cog4Q8R1U1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cog4Q8R1U1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cog4Q8R1U1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cog4Q8R1U1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cog4Q8R1U1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cog4Q8R1U1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cog4Q8R1U1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cog4Q8R1U1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cog4Q8R1U1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cog4Q8R1U1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cog4Q8R1U1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cog4Q8R1U1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cog4Q8R1U1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cog4Q8R1U1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cog4Q8R1U1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cog4Q8R1U1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cog4Q8R1U1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cog4Q8R1U1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cog4Q8R1U1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.7 ms