Protein–RNA interactions for Protein: Q8K288

Tnfaip8l1, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l1Q8K288 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnfaip8l1Q8K288 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tnfaip8l1Q8K288 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfaip8l1Q8K288 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfaip8l1Q8K288 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnfaip8l1Q8K288 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfaip8l1Q8K288 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfaip8l1Q8K288 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfaip8l1Q8K288 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnfaip8l1Q8K288 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnfaip8l1Q8K288 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnfaip8l1Q8K288 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnfaip8l1Q8K288 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnfaip8l1Q8K288 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnfaip8l1Q8K288 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnfaip8l1Q8K288 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnfaip8l1Q8K288 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnfaip8l1Q8K288 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnfaip8l1Q8K288 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnfaip8l1Q8K288 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnfaip8l1Q8K288 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfaip8l1Q8K288 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfaip8l1Q8K288 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfaip8l1Q8K288 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfaip8l1Q8K288 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnfaip8l1Q8K288 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnfaip8l1Q8K288 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfaip8l1Q8K288 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnfaip8l1Q8K288 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnfaip8l1Q8K288 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfaip8l1Q8K288 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfaip8l1Q8K288 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfaip8l1Q8K288 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfaip8l1Q8K288 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnfaip8l1Q8K288 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnfaip8l1Q8K288 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnfaip8l1Q8K288 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnfaip8l1Q8K288 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnfaip8l1Q8K288 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnfaip8l1Q8K288 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnfaip8l1Q8K288 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnfaip8l1Q8K288 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnfaip8l1Q8K288 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnfaip8l1Q8K288 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnfaip8l1Q8K288 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnfaip8l1Q8K288 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfaip8l1Q8K288 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfaip8l1Q8K288 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfaip8l1Q8K288 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnfaip8l1Q8K288 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnfaip8l1Q8K288 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnfaip8l1Q8K288 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnfaip8l1Q8K288 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnfaip8l1Q8K288 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnfaip8l1Q8K288 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnfaip8l1Q8K288 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnfaip8l1Q8K288 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnfaip8l1Q8K288 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnfaip8l1Q8K288 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnfaip8l1Q8K288 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfaip8l1Q8K288 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfaip8l1Q8K288 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnfaip8l1Q8K288 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnfaip8l1Q8K288 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnfaip8l1Q8K288 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnfaip8l1Q8K288 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnfaip8l1Q8K288 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnfaip8l1Q8K288 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnfaip8l1Q8K288 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnfaip8l1Q8K288 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnfaip8l1Q8K288 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnfaip8l1Q8K288 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnfaip8l1Q8K288 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnfaip8l1Q8K288 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnfaip8l1Q8K288 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnfaip8l1Q8K288 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnfaip8l1Q8K288 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnfaip8l1Q8K288 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnfaip8l1Q8K288 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnfaip8l1Q8K288 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnfaip8l1Q8K288 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnfaip8l1Q8K288 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnfaip8l1Q8K288 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnfaip8l1Q8K288 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnfaip8l1Q8K288 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnfaip8l1Q8K288 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfaip8l1Q8K288 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfaip8l1Q8K288 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfaip8l1Q8K288 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfaip8l1Q8K288 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfaip8l1Q8K288 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnfaip8l1Q8K288 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnfaip8l1Q8K288 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnfaip8l1Q8K288 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnfaip8l1Q8K288 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnfaip8l1Q8K288 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnfaip8l1Q8K288 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnfaip8l1Q8K288 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfaip8l1Q8K288 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfaip8l1Q8K288 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms