Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cldn34c1Q8K193 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cldn34c1Q8K193 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cldn34c1Q8K193 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cldn34c1Q8K193 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cldn34c1Q8K193 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cldn34c1Q8K193 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cldn34c1Q8K193 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cldn34c1Q8K193 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cldn34c1Q8K193 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cldn34c1Q8K193 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cldn34c1Q8K193 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cldn34c1Q8K193 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cldn34c1Q8K193 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn34c1Q8K193 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn34c1Q8K193 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn34c1Q8K193 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn34c1Q8K193 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn34c1Q8K193 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn34c1Q8K193 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn34c1Q8K193 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn34c1Q8K193 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn34c1Q8K193 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn34c1Q8K193 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cldn34c1Q8K193 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cldn34c1Q8K193 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cldn34c1Q8K193 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn34c1Q8K193 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn34c1Q8K193 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn34c1Q8K193 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn34c1Q8K193 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn34c1Q8K193 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn34c1Q8K193 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn34c1Q8K193 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn34c1Q8K193 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cldn34c1Q8K193 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cldn34c1Q8K193 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cldn34c1Q8K193 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Cldn34c1Q8K193 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn34c1Q8K193 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn34c1Q8K193 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn34c1Q8K193 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn34c1Q8K193 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn34c1Q8K193 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn34c1Q8K193 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn34c1Q8K193 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cldn34c1Q8K193 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cldn34c1Q8K193 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn34c1Q8K193 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn34c1Q8K193 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn34c1Q8K193 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn34c1Q8K193 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn34c1Q8K193 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn34c1Q8K193 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn34c1Q8K193 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn34c1Q8K193 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn34c1Q8K193 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cldn34c1Q8K193 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn34c1Q8K193 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn34c1Q8K193 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn34c1Q8K193 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn34c1Q8K193 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn34c1Q8K193 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn34c1Q8K193 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn34c1Q8K193 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn34c1Q8K193 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn34c1Q8K193 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn34c1Q8K193 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn34c1Q8K193 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn34c1Q8K193 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn34c1Q8K193 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn34c1Q8K193 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn34c1Q8K193 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn34c1Q8K193 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn34c1Q8K193 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn34c1Q8K193 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn34c1Q8K193 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn34c1Q8K193 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cldn34c1Q8K193 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cldn34c1Q8K193 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn34c1Q8K193 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn34c1Q8K193 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn34c1Q8K193 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn34c1Q8K193 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn34c1Q8K193 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn34c1Q8K193 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn34c1Q8K193 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn34c1Q8K193 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn34c1Q8K193 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn34c1Q8K193 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn34c1Q8K193 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn34c1Q8K193 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn34c1Q8K193 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn34c1Q8K193 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn34c1Q8K193 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn34c1Q8K193 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn34c1Q8K193 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn34c1Q8K193 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn34c1Q8K193 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn34c1Q8K193 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms