Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGK6

Ifnl3, Interferon lambda-3, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnl3Q8CGK6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ifnl3Q8CGK6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ifnl3Q8CGK6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ifnl3Q8CGK6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifnl3Q8CGK6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifnl3Q8CGK6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifnl3Q8CGK6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifnl3Q8CGK6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ifnl3Q8CGK6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ifnl3Q8CGK6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ifnl3Q8CGK6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ifnl3Q8CGK6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ifnl3Q8CGK6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ifnl3Q8CGK6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ifnl3Q8CGK6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ifnl3Q8CGK6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ifnl3Q8CGK6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ifnl3Q8CGK6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ifnl3Q8CGK6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ifnl3Q8CGK6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ifnl3Q8CGK6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ifnl3Q8CGK6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ifnl3Q8CGK6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ifnl3Q8CGK6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ifnl3Q8CGK6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ifnl3Q8CGK6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ifnl3Q8CGK6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ifnl3Q8CGK6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ifnl3Q8CGK6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ifnl3Q8CGK6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ifnl3Q8CGK6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ifnl3Q8CGK6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ifnl3Q8CGK6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ifnl3Q8CGK6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ifnl3Q8CGK6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ifnl3Q8CGK6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ifnl3Q8CGK6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ifnl3Q8CGK6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ifnl3Q8CGK6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ifnl3Q8CGK6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ifnl3Q8CGK6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ifnl3Q8CGK6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ifnl3Q8CGK6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ifnl3Q8CGK6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ifnl3Q8CGK6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ifnl3Q8CGK6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ifnl3Q8CGK6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ifnl3Q8CGK6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ifnl3Q8CGK6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ifnl3Q8CGK6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifnl3Q8CGK6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifnl3Q8CGK6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifnl3Q8CGK6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifnl3Q8CGK6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifnl3Q8CGK6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifnl3Q8CGK6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ifnl3Q8CGK6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ifnl3Q8CGK6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ifnl3Q8CGK6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ifnl3Q8CGK6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ifnl3Q8CGK6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ifnl3Q8CGK6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ifnl3Q8CGK6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ifnl3Q8CGK6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ifnl3Q8CGK6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ifnl3Q8CGK6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ifnl3Q8CGK6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ifnl3Q8CGK6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ifnl3Q8CGK6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ifnl3Q8CGK6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ifnl3Q8CGK6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ifnl3Q8CGK6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ifnl3Q8CGK6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ifnl3Q8CGK6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ifnl3Q8CGK6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ifnl3Q8CGK6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ifnl3Q8CGK6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ifnl3Q8CGK6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ifnl3Q8CGK6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ifnl3Q8CGK6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ifnl3Q8CGK6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ifnl3Q8CGK6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ifnl3Q8CGK6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ifnl3Q8CGK6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ifnl3Q8CGK6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ifnl3Q8CGK6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ifnl3Q8CGK6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ifnl3Q8CGK6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ifnl3Q8CGK6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ifnl3Q8CGK6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ifnl3Q8CGK6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ifnl3Q8CGK6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ifnl3Q8CGK6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ifnl3Q8CGK6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ifnl3Q8CGK6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ifnl3Q8CGK6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ifnl3Q8CGK6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ifnl3Q8CGK6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ifnl3Q8CGK6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ifnl3Q8CGK6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms