Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBW7

Chic1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chic1Q8CBW7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
Chic1Q8CBW7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC41.84■■■■■ 4.29
Chic1Q8CBW7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
Chic1Q8CBW7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
Chic1Q8CBW7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
Chic1Q8CBW7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
Chic1Q8CBW7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
Chic1Q8CBW7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
Chic1Q8CBW7 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC41.82■■■■■ 4.29
Chic1Q8CBW7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Chic1Q8CBW7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Chic1Q8CBW7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
Chic1Q8CBW7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
Chic1Q8CBW7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
Chic1Q8CBW7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC41.77■■■■■ 4.28
Chic1Q8CBW7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
Chic1Q8CBW7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
Chic1Q8CBW7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
Chic1Q8CBW7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
Chic1Q8CBW7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.73■■■■■ 4.27
Chic1Q8CBW7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC41.72■■■■■ 4.27
Chic1Q8CBW7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
Chic1Q8CBW7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.7■■■■■ 4.27
Chic1Q8CBW7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC41.7■■■■■ 4.27
Chic1Q8CBW7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC41.69■■■■■ 4.27
Chic1Q8CBW7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
Chic1Q8CBW7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC41.68■■■■■ 4.26
Chic1Q8CBW7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
Chic1Q8CBW7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC41.67■■■■■ 4.26
Chic1Q8CBW7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
Chic1Q8CBW7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
Chic1Q8CBW7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
Chic1Q8CBW7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
Chic1Q8CBW7 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Chic1Q8CBW7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
Chic1Q8CBW7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
Chic1Q8CBW7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
Chic1Q8CBW7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
Chic1Q8CBW7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
Chic1Q8CBW7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
Chic1Q8CBW7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
Chic1Q8CBW7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC41.5■■■■■ 4.23
Chic1Q8CBW7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Chic1Q8CBW7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Chic1Q8CBW7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
Chic1Q8CBW7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
Chic1Q8CBW7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
Chic1Q8CBW7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
Chic1Q8CBW7 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
Chic1Q8CBW7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
Chic1Q8CBW7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
Chic1Q8CBW7 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Chic1Q8CBW7 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
Chic1Q8CBW7 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
Chic1Q8CBW7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
Chic1Q8CBW7 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
Chic1Q8CBW7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
Chic1Q8CBW7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
Chic1Q8CBW7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC41.41■■■■■ 4.22
Chic1Q8CBW7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
Chic1Q8CBW7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
Chic1Q8CBW7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
Chic1Q8CBW7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
Chic1Q8CBW7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
Chic1Q8CBW7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
Chic1Q8CBW7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Chic1Q8CBW7 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC41.38■■■■■ 4.21
Chic1Q8CBW7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
Chic1Q8CBW7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
Chic1Q8CBW7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.21
Chic1Q8CBW7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
Chic1Q8CBW7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Chic1Q8CBW7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC41.36■■■■■ 4.21
Chic1Q8CBW7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Chic1Q8CBW7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Chic1Q8CBW7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Chic1Q8CBW7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
Chic1Q8CBW7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
Chic1Q8CBW7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
Chic1Q8CBW7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
Chic1Q8CBW7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
Chic1Q8CBW7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
Chic1Q8CBW7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Chic1Q8CBW7 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC41.26■■■■■ 4.2
Chic1Q8CBW7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
Chic1Q8CBW7 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Chic1Q8CBW7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Chic1Q8CBW7 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC41.21■■■■■ 4.19
Chic1Q8CBW7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
Chic1Q8CBW7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC41.2■■■■■ 4.19
Chic1Q8CBW7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Chic1Q8CBW7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC41.19■■■■■ 4.18
Chic1Q8CBW7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
Chic1Q8CBW7 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
Chic1Q8CBW7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Chic1Q8CBW7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Chic1Q8CBW7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC41.14■■■■■ 4.18
Chic1Q8CBW7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Chic1Q8CBW7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.18
Chic1Q8CBW7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms