Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY35

Fgd2, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd2Q8BY35 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Fgd2Q8BY35 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fgd2Q8BY35 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fgd2Q8BY35 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fgd2Q8BY35 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fgd2Q8BY35 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fgd2Q8BY35 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fgd2Q8BY35 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fgd2Q8BY35 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fgd2Q8BY35 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fgd2Q8BY35 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fgd2Q8BY35 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fgd2Q8BY35 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fgd2Q8BY35 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fgd2Q8BY35 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fgd2Q8BY35 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fgd2Q8BY35 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fgd2Q8BY35 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fgd2Q8BY35 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Fgd2Q8BY35 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fgd2Q8BY35 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fgd2Q8BY35 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fgd2Q8BY35 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fgd2Q8BY35 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Fgd2Q8BY35 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fgd2Q8BY35 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fgd2Q8BY35 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fgd2Q8BY35 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fgd2Q8BY35 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fgd2Q8BY35 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fgd2Q8BY35 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Fgd2Q8BY35 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fgd2Q8BY35 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fgd2Q8BY35 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fgd2Q8BY35 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fgd2Q8BY35 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Fgd2Q8BY35 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fgd2Q8BY35 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fgd2Q8BY35 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fgd2Q8BY35 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fgd2Q8BY35 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fgd2Q8BY35 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fgd2Q8BY35 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fgd2Q8BY35 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fgd2Q8BY35 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fgd2Q8BY35 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fgd2Q8BY35 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fgd2Q8BY35 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fgd2Q8BY35 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fgd2Q8BY35 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fgd2Q8BY35 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fgd2Q8BY35 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fgd2Q8BY35 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fgd2Q8BY35 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fgd2Q8BY35 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fgd2Q8BY35 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fgd2Q8BY35 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fgd2Q8BY35 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fgd2Q8BY35 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fgd2Q8BY35 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fgd2Q8BY35 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fgd2Q8BY35 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fgd2Q8BY35 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fgd2Q8BY35 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Fgd2Q8BY35 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fgd2Q8BY35 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fgd2Q8BY35 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fgd2Q8BY35 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fgd2Q8BY35 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fgd2Q8BY35 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fgd2Q8BY35 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fgd2Q8BY35 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fgd2Q8BY35 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fgd2Q8BY35 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fgd2Q8BY35 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fgd2Q8BY35 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fgd2Q8BY35 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fgd2Q8BY35 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fgd2Q8BY35 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fgd2Q8BY35 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fgd2Q8BY35 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fgd2Q8BY35 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fgd2Q8BY35 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fgd2Q8BY35 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fgd2Q8BY35 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fgd2Q8BY35 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fgd2Q8BY35 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Fgd2Q8BY35 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fgd2Q8BY35 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fgd2Q8BY35 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fgd2Q8BY35 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fgd2Q8BY35 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fgd2Q8BY35 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd2Q8BY35 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd2Q8BY35 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd2Q8BY35 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd2Q8BY35 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd2Q8BY35 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd2Q8BY35 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fgd2Q8BY35 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms