Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX70

Vps13c, Vacuolar protein sorting-associated protein 13C, mousemouse

Predictions only

Length 3,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps13cQ8BX70 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps13cQ8BX70 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps13cQ8BX70 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps13cQ8BX70 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps13cQ8BX70 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps13cQ8BX70 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps13cQ8BX70 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps13cQ8BX70 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps13cQ8BX70 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps13cQ8BX70 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps13cQ8BX70 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps13cQ8BX70 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps13cQ8BX70 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps13cQ8BX70 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps13cQ8BX70 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps13cQ8BX70 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps13cQ8BX70 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps13cQ8BX70 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps13cQ8BX70 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps13cQ8BX70 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps13cQ8BX70 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps13cQ8BX70 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps13cQ8BX70 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps13cQ8BX70 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps13cQ8BX70 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps13cQ8BX70 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps13cQ8BX70 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps13cQ8BX70 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps13cQ8BX70 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps13cQ8BX70 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps13cQ8BX70 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps13cQ8BX70 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps13cQ8BX70 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps13cQ8BX70 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps13cQ8BX70 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps13cQ8BX70 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps13cQ8BX70 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Vps13cQ8BX70 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps13cQ8BX70 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps13cQ8BX70 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps13cQ8BX70 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps13cQ8BX70 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps13cQ8BX70 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps13cQ8BX70 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps13cQ8BX70 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps13cQ8BX70 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps13cQ8BX70 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps13cQ8BX70 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps13cQ8BX70 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps13cQ8BX70 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps13cQ8BX70 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps13cQ8BX70 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps13cQ8BX70 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps13cQ8BX70 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps13cQ8BX70 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps13cQ8BX70 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps13cQ8BX70 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps13cQ8BX70 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps13cQ8BX70 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps13cQ8BX70 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps13cQ8BX70 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vps13cQ8BX70 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps13cQ8BX70 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps13cQ8BX70 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps13cQ8BX70 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps13cQ8BX70 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps13cQ8BX70 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps13cQ8BX70 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps13cQ8BX70 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps13cQ8BX70 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps13cQ8BX70 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps13cQ8BX70 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps13cQ8BX70 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps13cQ8BX70 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps13cQ8BX70 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vps13cQ8BX70 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps13cQ8BX70 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps13cQ8BX70 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps13cQ8BX70 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps13cQ8BX70 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps13cQ8BX70 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps13cQ8BX70 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps13cQ8BX70 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps13cQ8BX70 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps13cQ8BX70 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps13cQ8BX70 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps13cQ8BX70 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps13cQ8BX70 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Vps13cQ8BX70 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps13cQ8BX70 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps13cQ8BX70 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps13cQ8BX70 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps13cQ8BX70 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps13cQ8BX70 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps13cQ8BX70 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps13cQ8BX70 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps13cQ8BX70 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps13cQ8BX70 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps13cQ8BX70 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps13cQ8BX70 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms