Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS3

Gbp9, Guanylate-binding protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp9Q8BTS3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gbp9Q8BTS3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gbp9Q8BTS3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gbp9Q8BTS3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gbp9Q8BTS3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gbp9Q8BTS3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gbp9Q8BTS3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gbp9Q8BTS3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gbp9Q8BTS3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gbp9Q8BTS3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gbp9Q8BTS3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gbp9Q8BTS3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gbp9Q8BTS3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gbp9Q8BTS3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gbp9Q8BTS3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gbp9Q8BTS3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gbp9Q8BTS3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gbp9Q8BTS3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gbp9Q8BTS3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gbp9Q8BTS3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gbp9Q8BTS3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gbp9Q8BTS3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gbp9Q8BTS3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gbp9Q8BTS3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gbp9Q8BTS3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gbp9Q8BTS3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gbp9Q8BTS3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gbp9Q8BTS3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gbp9Q8BTS3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gbp9Q8BTS3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gbp9Q8BTS3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gbp9Q8BTS3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gbp9Q8BTS3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gbp9Q8BTS3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gbp9Q8BTS3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gbp9Q8BTS3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gbp9Q8BTS3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gbp9Q8BTS3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gbp9Q8BTS3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gbp9Q8BTS3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gbp9Q8BTS3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gbp9Q8BTS3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gbp9Q8BTS3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gbp9Q8BTS3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gbp9Q8BTS3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gbp9Q8BTS3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gbp9Q8BTS3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gbp9Q8BTS3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gbp9Q8BTS3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gbp9Q8BTS3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gbp9Q8BTS3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gbp9Q8BTS3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gbp9Q8BTS3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gbp9Q8BTS3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gbp9Q8BTS3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gbp9Q8BTS3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gbp9Q8BTS3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gbp9Q8BTS3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gbp9Q8BTS3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gbp9Q8BTS3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gbp9Q8BTS3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gbp9Q8BTS3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gbp9Q8BTS3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gbp9Q8BTS3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gbp9Q8BTS3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gbp9Q8BTS3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Gbp9Q8BTS3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gbp9Q8BTS3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gbp9Q8BTS3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gbp9Q8BTS3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gbp9Q8BTS3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gbp9Q8BTS3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gbp9Q8BTS3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gbp9Q8BTS3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gbp9Q8BTS3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gbp9Q8BTS3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gbp9Q8BTS3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gbp9Q8BTS3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gbp9Q8BTS3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gbp9Q8BTS3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gbp9Q8BTS3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gbp9Q8BTS3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gbp9Q8BTS3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gbp9Q8BTS3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gbp9Q8BTS3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gbp9Q8BTS3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gbp9Q8BTS3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gbp9Q8BTS3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gbp9Q8BTS3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gbp9Q8BTS3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gbp9Q8BTS3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gbp9Q8BTS3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gbp9Q8BTS3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gbp9Q8BTS3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gbp9Q8BTS3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gbp9Q8BTS3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gbp9Q8BTS3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gbp9Q8BTS3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gbp9Q8BTS3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Gbp9Q8BTS3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms