Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSZ2

Ap3s2, AP-3 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s2Q8BSZ2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ap3s2Q8BSZ2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap3s2Q8BSZ2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap3s2Q8BSZ2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ap3s2Q8BSZ2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ap3s2Q8BSZ2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ap3s2Q8BSZ2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ap3s2Q8BSZ2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ap3s2Q8BSZ2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ap3s2Q8BSZ2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap3s2Q8BSZ2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap3s2Q8BSZ2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ap3s2Q8BSZ2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ap3s2Q8BSZ2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ap3s2Q8BSZ2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ap3s2Q8BSZ2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ap3s2Q8BSZ2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ap3s2Q8BSZ2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ap3s2Q8BSZ2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ap3s2Q8BSZ2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ap3s2Q8BSZ2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ap3s2Q8BSZ2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ap3s2Q8BSZ2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3s2Q8BSZ2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3s2Q8BSZ2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3s2Q8BSZ2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ap3s2Q8BSZ2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ap3s2Q8BSZ2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ap3s2Q8BSZ2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ap3s2Q8BSZ2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ap3s2Q8BSZ2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ap3s2Q8BSZ2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap3s2Q8BSZ2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap3s2Q8BSZ2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap3s2Q8BSZ2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ap3s2Q8BSZ2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ap3s2Q8BSZ2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ap3s2Q8BSZ2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap3s2Q8BSZ2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap3s2Q8BSZ2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap3s2Q8BSZ2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap3s2Q8BSZ2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ap3s2Q8BSZ2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ap3s2Q8BSZ2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ap3s2Q8BSZ2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ap3s2Q8BSZ2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap3s2Q8BSZ2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap3s2Q8BSZ2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap3s2Q8BSZ2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap3s2Q8BSZ2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ap3s2Q8BSZ2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ap3s2Q8BSZ2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ap3s2Q8BSZ2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ap3s2Q8BSZ2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ap3s2Q8BSZ2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ap3s2Q8BSZ2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ap3s2Q8BSZ2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ap3s2Q8BSZ2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ap3s2Q8BSZ2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ap3s2Q8BSZ2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ap3s2Q8BSZ2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ap3s2Q8BSZ2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ap3s2Q8BSZ2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ap3s2Q8BSZ2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ap3s2Q8BSZ2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ap3s2Q8BSZ2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ap3s2Q8BSZ2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ap3s2Q8BSZ2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ap3s2Q8BSZ2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ap3s2Q8BSZ2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ap3s2Q8BSZ2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ap3s2Q8BSZ2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ap3s2Q8BSZ2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ap3s2Q8BSZ2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ap3s2Q8BSZ2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ap3s2Q8BSZ2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ap3s2Q8BSZ2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ap3s2Q8BSZ2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ap3s2Q8BSZ2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ap3s2Q8BSZ2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ap3s2Q8BSZ2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ap3s2Q8BSZ2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ap3s2Q8BSZ2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ap3s2Q8BSZ2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ap3s2Q8BSZ2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ap3s2Q8BSZ2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ap3s2Q8BSZ2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ap3s2Q8BSZ2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap3s2Q8BSZ2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap3s2Q8BSZ2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap3s2Q8BSZ2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ap3s2Q8BSZ2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ap3s2Q8BSZ2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ap3s2Q8BSZ2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap3s2Q8BSZ2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap3s2Q8BSZ2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap3s2Q8BSZ2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap3s2Q8BSZ2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap3s2Q8BSZ2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap3s2Q8BSZ2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.2 ms