Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHW4

4933430I17Rik, RIKEN cDNA 4933430I17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933430I17RikQ8BHW4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
4933430I17RikQ8BHW4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4933430I17RikQ8BHW4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4933430I17RikQ8BHW4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4933430I17RikQ8BHW4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4933430I17RikQ8BHW4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4933430I17RikQ8BHW4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4933430I17RikQ8BHW4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4933430I17RikQ8BHW4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4933430I17RikQ8BHW4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
4933430I17RikQ8BHW4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4933430I17RikQ8BHW4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
4933430I17RikQ8BHW4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
4933430I17RikQ8BHW4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4933430I17RikQ8BHW4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
4933430I17RikQ8BHW4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4933430I17RikQ8BHW4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
4933430I17RikQ8BHW4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4933430I17RikQ8BHW4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
4933430I17RikQ8BHW4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
4933430I17RikQ8BHW4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4933430I17RikQ8BHW4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4933430I17RikQ8BHW4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4933430I17RikQ8BHW4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
4933430I17RikQ8BHW4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4933430I17RikQ8BHW4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
4933430I17RikQ8BHW4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
4933430I17RikQ8BHW4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4933430I17RikQ8BHW4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4933430I17RikQ8BHW4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
4933430I17RikQ8BHW4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4933430I17RikQ8BHW4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
4933430I17RikQ8BHW4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
4933430I17RikQ8BHW4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
4933430I17RikQ8BHW4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4933430I17RikQ8BHW4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4933430I17RikQ8BHW4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4933430I17RikQ8BHW4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4933430I17RikQ8BHW4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
4933430I17RikQ8BHW4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
4933430I17RikQ8BHW4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
4933430I17RikQ8BHW4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4933430I17RikQ8BHW4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4933430I17RikQ8BHW4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
4933430I17RikQ8BHW4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4933430I17RikQ8BHW4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
4933430I17RikQ8BHW4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4933430I17RikQ8BHW4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4933430I17RikQ8BHW4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4933430I17RikQ8BHW4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
4933430I17RikQ8BHW4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4933430I17RikQ8BHW4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4933430I17RikQ8BHW4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
4933430I17RikQ8BHW4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4933430I17RikQ8BHW4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4933430I17RikQ8BHW4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4933430I17RikQ8BHW4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4933430I17RikQ8BHW4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
4933430I17RikQ8BHW4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4933430I17RikQ8BHW4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4933430I17RikQ8BHW4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4933430I17RikQ8BHW4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4933430I17RikQ8BHW4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4933430I17RikQ8BHW4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4933430I17RikQ8BHW4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4933430I17RikQ8BHW4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4933430I17RikQ8BHW4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4933430I17RikQ8BHW4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4933430I17RikQ8BHW4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4933430I17RikQ8BHW4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4933430I17RikQ8BHW4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
4933430I17RikQ8BHW4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
4933430I17RikQ8BHW4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4933430I17RikQ8BHW4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4933430I17RikQ8BHW4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4933430I17RikQ8BHW4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4933430I17RikQ8BHW4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4933430I17RikQ8BHW4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
4933430I17RikQ8BHW4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4933430I17RikQ8BHW4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4933430I17RikQ8BHW4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
4933430I17RikQ8BHW4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4933430I17RikQ8BHW4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4933430I17RikQ8BHW4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4933430I17RikQ8BHW4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933430I17RikQ8BHW4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933430I17RikQ8BHW4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933430I17RikQ8BHW4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933430I17RikQ8BHW4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933430I17RikQ8BHW4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933430I17RikQ8BHW4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933430I17RikQ8BHW4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4933430I17RikQ8BHW4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4933430I17RikQ8BHW4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
4933430I17RikQ8BHW4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4933430I17RikQ8BHW4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4933430I17RikQ8BHW4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933430I17RikQ8BHW4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4933430I17RikQ8BHW4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4933430I17RikQ8BHW4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms