Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y20

Alkbh8, Alkylated DNA repair protein alkB homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh8Q80Y20 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Alkbh8Q80Y20 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Alkbh8Q80Y20 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Alkbh8Q80Y20 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Alkbh8Q80Y20 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Alkbh8Q80Y20 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Alkbh8Q80Y20 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Alkbh8Q80Y20 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Alkbh8Q80Y20 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Alkbh8Q80Y20 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Alkbh8Q80Y20 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Alkbh8Q80Y20 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Alkbh8Q80Y20 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Alkbh8Q80Y20 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Alkbh8Q80Y20 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Alkbh8Q80Y20 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Alkbh8Q80Y20 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Alkbh8Q80Y20 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Alkbh8Q80Y20 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Alkbh8Q80Y20 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Alkbh8Q80Y20 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Alkbh8Q80Y20 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Alkbh8Q80Y20 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Alkbh8Q80Y20 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Alkbh8Q80Y20 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Alkbh8Q80Y20 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Alkbh8Q80Y20 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Alkbh8Q80Y20 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Alkbh8Q80Y20 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Alkbh8Q80Y20 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Alkbh8Q80Y20 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Alkbh8Q80Y20 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Alkbh8Q80Y20 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Alkbh8Q80Y20 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Alkbh8Q80Y20 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Alkbh8Q80Y20 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Alkbh8Q80Y20 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Alkbh8Q80Y20 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Alkbh8Q80Y20 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Alkbh8Q80Y20 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Alkbh8Q80Y20 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Alkbh8Q80Y20 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Alkbh8Q80Y20 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Alkbh8Q80Y20 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Alkbh8Q80Y20 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Alkbh8Q80Y20 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Alkbh8Q80Y20 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Alkbh8Q80Y20 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Alkbh8Q80Y20 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Alkbh8Q80Y20 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Alkbh8Q80Y20 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Alkbh8Q80Y20 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Alkbh8Q80Y20 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Alkbh8Q80Y20 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Alkbh8Q80Y20 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Alkbh8Q80Y20 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Alkbh8Q80Y20 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Alkbh8Q80Y20 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Alkbh8Q80Y20 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Alkbh8Q80Y20 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Alkbh8Q80Y20 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Alkbh8Q80Y20 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Alkbh8Q80Y20 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Alkbh8Q80Y20 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Alkbh8Q80Y20 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Alkbh8Q80Y20 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Alkbh8Q80Y20 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Alkbh8Q80Y20 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Alkbh8Q80Y20 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Alkbh8Q80Y20 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Alkbh8Q80Y20 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Alkbh8Q80Y20 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Alkbh8Q80Y20 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Alkbh8Q80Y20 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Alkbh8Q80Y20 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Alkbh8Q80Y20 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Alkbh8Q80Y20 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Alkbh8Q80Y20 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Alkbh8Q80Y20 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Alkbh8Q80Y20 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Alkbh8Q80Y20 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Alkbh8Q80Y20 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Alkbh8Q80Y20 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Alkbh8Q80Y20 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Alkbh8Q80Y20 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Alkbh8Q80Y20 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Alkbh8Q80Y20 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Alkbh8Q80Y20 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Alkbh8Q80Y20 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Alkbh8Q80Y20 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Alkbh8Q80Y20 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Alkbh8Q80Y20 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Alkbh8Q80Y20 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Alkbh8Q80Y20 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Alkbh8Q80Y20 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Alkbh8Q80Y20 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Alkbh8Q80Y20 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Alkbh8Q80Y20 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Alkbh8Q80Y20 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Alkbh8Q80Y20 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms