Protein–RNA interactions for Protein: Q80U49

Cep170b, Centrosomal protein of 170 kDa protein B, mousemouse

Predictions only

Length 1,574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170bQ80U49 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Cep170bQ80U49 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Cep170bQ80U49 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Cep170bQ80U49 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Cep170bQ80U49 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
Cep170bQ80U49 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Cep170bQ80U49 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Cep170bQ80U49 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Cep170bQ80U49 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Cep170bQ80U49 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Cep170bQ80U49 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Cep170bQ80U49 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Cep170bQ80U49 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Cep170bQ80U49 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.18
Cep170bQ80U49 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Cep170bQ80U49 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Cep170bQ80U49 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Cep170bQ80U49 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Cep170bQ80U49 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Cep170bQ80U49 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Cep170bQ80U49 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Cep170bQ80U49 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Cep170bQ80U49 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Cep170bQ80U49 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Cep170bQ80U49 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Cep170bQ80U49 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Cep170bQ80U49 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Cep170bQ80U49 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Cep170bQ80U49 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Cep170bQ80U49 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Cep170bQ80U49 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Cep170bQ80U49 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
Cep170bQ80U49 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Cep170bQ80U49 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Cep170bQ80U49 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Cep170bQ80U49 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
Cep170bQ80U49 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Cep170bQ80U49 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Cep170bQ80U49 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Cep170bQ80U49 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cep170bQ80U49 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cep170bQ80U49 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cep170bQ80U49 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Cep170bQ80U49 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Cep170bQ80U49 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Cep170bQ80U49 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cep170bQ80U49 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Cep170bQ80U49 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Cep170bQ80U49 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Cep170bQ80U49 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Cep170bQ80U49 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Cep170bQ80U49 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Cep170bQ80U49 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Cep170bQ80U49 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Cep170bQ80U49 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Cep170bQ80U49 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Cep170bQ80U49 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Cep170bQ80U49 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Cep170bQ80U49 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Cep170bQ80U49 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Cep170bQ80U49 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Cep170bQ80U49 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Cep170bQ80U49 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Cep170bQ80U49 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Cep170bQ80U49 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Cep170bQ80U49 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Cep170bQ80U49 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Cep170bQ80U49 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Cep170bQ80U49 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Cep170bQ80U49 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Cep170bQ80U49 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Cep170bQ80U49 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Cep170bQ80U49 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Cep170bQ80U49 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Cep170bQ80U49 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Cep170bQ80U49 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Cep170bQ80U49 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Cep170bQ80U49 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Cep170bQ80U49 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Cep170bQ80U49 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Cep170bQ80U49 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Cep170bQ80U49 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Cep170bQ80U49 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Cep170bQ80U49 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Cep170bQ80U49 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cep170bQ80U49 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Cep170bQ80U49 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Cep170bQ80U49 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cep170bQ80U49 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cep170bQ80U49 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cep170bQ80U49 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cep170bQ80U49 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cep170bQ80U49 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cep170bQ80U49 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cep170bQ80U49 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Cep170bQ80U49 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Cep170bQ80U49 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Cep170bQ80U49 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Cep170bQ80U49 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Cep170bQ80U49 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms