Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnih3Q6ZWS4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnih3Q6ZWS4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnih3Q6ZWS4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnih3Q6ZWS4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnih3Q6ZWS4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnih3Q6ZWS4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnih3Q6ZWS4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnih3Q6ZWS4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnih3Q6ZWS4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnih3Q6ZWS4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnih3Q6ZWS4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnih3Q6ZWS4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cnih3Q6ZWS4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cnih3Q6ZWS4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnih3Q6ZWS4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnih3Q6ZWS4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnih3Q6ZWS4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnih3Q6ZWS4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnih3Q6ZWS4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnih3Q6ZWS4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnih3Q6ZWS4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnih3Q6ZWS4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnih3Q6ZWS4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnih3Q6ZWS4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cnih3Q6ZWS4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cnih3Q6ZWS4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnih3Q6ZWS4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnih3Q6ZWS4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnih3Q6ZWS4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnih3Q6ZWS4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnih3Q6ZWS4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnih3Q6ZWS4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnih3Q6ZWS4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnih3Q6ZWS4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnih3Q6ZWS4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnih3Q6ZWS4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnih3Q6ZWS4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnih3Q6ZWS4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnih3Q6ZWS4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnih3Q6ZWS4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnih3Q6ZWS4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnih3Q6ZWS4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnih3Q6ZWS4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnih3Q6ZWS4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnih3Q6ZWS4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnih3Q6ZWS4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnih3Q6ZWS4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnih3Q6ZWS4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnih3Q6ZWS4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnih3Q6ZWS4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnih3Q6ZWS4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnih3Q6ZWS4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnih3Q6ZWS4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnih3Q6ZWS4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnih3Q6ZWS4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnih3Q6ZWS4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnih3Q6ZWS4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnih3Q6ZWS4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnih3Q6ZWS4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnih3Q6ZWS4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnih3Q6ZWS4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnih3Q6ZWS4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnih3Q6ZWS4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnih3Q6ZWS4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnih3Q6ZWS4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnih3Q6ZWS4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnih3Q6ZWS4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnih3Q6ZWS4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnih3Q6ZWS4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnih3Q6ZWS4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnih3Q6ZWS4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnih3Q6ZWS4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnih3Q6ZWS4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnih3Q6ZWS4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnih3Q6ZWS4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnih3Q6ZWS4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnih3Q6ZWS4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnih3Q6ZWS4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnih3Q6ZWS4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnih3Q6ZWS4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnih3Q6ZWS4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnih3Q6ZWS4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnih3Q6ZWS4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnih3Q6ZWS4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnih3Q6ZWS4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnih3Q6ZWS4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnih3Q6ZWS4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnih3Q6ZWS4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnih3Q6ZWS4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnih3Q6ZWS4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnih3Q6ZWS4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnih3Q6ZWS4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnih3Q6ZWS4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnih3Q6ZWS4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnih3Q6ZWS4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnih3Q6ZWS4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnih3Q6ZWS4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnih3Q6ZWS4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnih3Q6ZWS4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 165.9 ms