Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQA6

Igsf3, Immunoglobulin superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf3Q6ZQA6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Igsf3Q6ZQA6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Igsf3Q6ZQA6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Igsf3Q6ZQA6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Igsf3Q6ZQA6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Igsf3Q6ZQA6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Igsf3Q6ZQA6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Igsf3Q6ZQA6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Igsf3Q6ZQA6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Igsf3Q6ZQA6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Igsf3Q6ZQA6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Igsf3Q6ZQA6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Igsf3Q6ZQA6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Igsf3Q6ZQA6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Igsf3Q6ZQA6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Igsf3Q6ZQA6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Igsf3Q6ZQA6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Igsf3Q6ZQA6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Igsf3Q6ZQA6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Igsf3Q6ZQA6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Igsf3Q6ZQA6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Igsf3Q6ZQA6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Igsf3Q6ZQA6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Igsf3Q6ZQA6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Igsf3Q6ZQA6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Igsf3Q6ZQA6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Igsf3Q6ZQA6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Igsf3Q6ZQA6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Igsf3Q6ZQA6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Igsf3Q6ZQA6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Igsf3Q6ZQA6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Igsf3Q6ZQA6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Igsf3Q6ZQA6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Igsf3Q6ZQA6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Igsf3Q6ZQA6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Igsf3Q6ZQA6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Igsf3Q6ZQA6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Igsf3Q6ZQA6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Igsf3Q6ZQA6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Igsf3Q6ZQA6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Igsf3Q6ZQA6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Igsf3Q6ZQA6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Igsf3Q6ZQA6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Igsf3Q6ZQA6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Igsf3Q6ZQA6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Igsf3Q6ZQA6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Igsf3Q6ZQA6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Igsf3Q6ZQA6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Igsf3Q6ZQA6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Igsf3Q6ZQA6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Igsf3Q6ZQA6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Igsf3Q6ZQA6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Igsf3Q6ZQA6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Igsf3Q6ZQA6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Igsf3Q6ZQA6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Igsf3Q6ZQA6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Igsf3Q6ZQA6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Igsf3Q6ZQA6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Igsf3Q6ZQA6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Igsf3Q6ZQA6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Igsf3Q6ZQA6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Igsf3Q6ZQA6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Igsf3Q6ZQA6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Igsf3Q6ZQA6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Igsf3Q6ZQA6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Igsf3Q6ZQA6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Igsf3Q6ZQA6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Igsf3Q6ZQA6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Igsf3Q6ZQA6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Igsf3Q6ZQA6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Igsf3Q6ZQA6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Igsf3Q6ZQA6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Igsf3Q6ZQA6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Igsf3Q6ZQA6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Igsf3Q6ZQA6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Igsf3Q6ZQA6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Igsf3Q6ZQA6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Igsf3Q6ZQA6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Igsf3Q6ZQA6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Igsf3Q6ZQA6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Igsf3Q6ZQA6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Igsf3Q6ZQA6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Igsf3Q6ZQA6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Igsf3Q6ZQA6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Igsf3Q6ZQA6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Igsf3Q6ZQA6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Igsf3Q6ZQA6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Igsf3Q6ZQA6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Igsf3Q6ZQA6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Igsf3Q6ZQA6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Igsf3Q6ZQA6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Igsf3Q6ZQA6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Igsf3Q6ZQA6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Igsf3Q6ZQA6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Igsf3Q6ZQA6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Igsf3Q6ZQA6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Igsf3Q6ZQA6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Igsf3Q6ZQA6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Igsf3Q6ZQA6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Igsf3Q6ZQA6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms