Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC8

Mfsd4a, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4aQ6PDC8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mfsd4aQ6PDC8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Mfsd4aQ6PDC8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Mfsd4aQ6PDC8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mfsd4aQ6PDC8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mfsd4aQ6PDC8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mfsd4aQ6PDC8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mfsd4aQ6PDC8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mfsd4aQ6PDC8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mfsd4aQ6PDC8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Mfsd4aQ6PDC8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mfsd4aQ6PDC8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Mfsd4aQ6PDC8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mfsd4aQ6PDC8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Mfsd4aQ6PDC8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mfsd4aQ6PDC8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mfsd4aQ6PDC8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mfsd4aQ6PDC8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mfsd4aQ6PDC8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mfsd4aQ6PDC8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Mfsd4aQ6PDC8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mfsd4aQ6PDC8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mfsd4aQ6PDC8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mfsd4aQ6PDC8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mfsd4aQ6PDC8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mfsd4aQ6PDC8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mfsd4aQ6PDC8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mfsd4aQ6PDC8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mfsd4aQ6PDC8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mfsd4aQ6PDC8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mfsd4aQ6PDC8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mfsd4aQ6PDC8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mfsd4aQ6PDC8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mfsd4aQ6PDC8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mfsd4aQ6PDC8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mfsd4aQ6PDC8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mfsd4aQ6PDC8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Mfsd4aQ6PDC8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mfsd4aQ6PDC8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mfsd4aQ6PDC8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mfsd4aQ6PDC8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mfsd4aQ6PDC8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mfsd4aQ6PDC8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mfsd4aQ6PDC8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mfsd4aQ6PDC8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mfsd4aQ6PDC8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mfsd4aQ6PDC8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mfsd4aQ6PDC8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Mfsd4aQ6PDC8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mfsd4aQ6PDC8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mfsd4aQ6PDC8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Mfsd4aQ6PDC8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mfsd4aQ6PDC8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mfsd4aQ6PDC8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mfsd4aQ6PDC8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mfsd4aQ6PDC8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mfsd4aQ6PDC8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mfsd4aQ6PDC8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mfsd4aQ6PDC8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mfsd4aQ6PDC8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mfsd4aQ6PDC8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mfsd4aQ6PDC8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mfsd4aQ6PDC8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mfsd4aQ6PDC8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mfsd4aQ6PDC8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mfsd4aQ6PDC8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mfsd4aQ6PDC8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mfsd4aQ6PDC8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mfsd4aQ6PDC8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mfsd4aQ6PDC8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mfsd4aQ6PDC8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Mfsd4aQ6PDC8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mfsd4aQ6PDC8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mfsd4aQ6PDC8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mfsd4aQ6PDC8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mfsd4aQ6PDC8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mfsd4aQ6PDC8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mfsd4aQ6PDC8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mfsd4aQ6PDC8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mfsd4aQ6PDC8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mfsd4aQ6PDC8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mfsd4aQ6PDC8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mfsd4aQ6PDC8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mfsd4aQ6PDC8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mfsd4aQ6PDC8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mfsd4aQ6PDC8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mfsd4aQ6PDC8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mfsd4aQ6PDC8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mfsd4aQ6PDC8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mfsd4aQ6PDC8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mfsd4aQ6PDC8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mfsd4aQ6PDC8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mfsd4aQ6PDC8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mfsd4aQ6PDC8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mfsd4aQ6PDC8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mfsd4aQ6PDC8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mfsd4aQ6PDC8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mfsd4aQ6PDC8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mfsd4aQ6PDC8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mfsd4aQ6PDC8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms