Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8W9

Hmgb4, High mobility group protein B4, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb4Q6P8W9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hmgb4Q6P8W9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hmgb4Q6P8W9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hmgb4Q6P8W9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hmgb4Q6P8W9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Hmgb4Q6P8W9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hmgb4Q6P8W9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hmgb4Q6P8W9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hmgb4Q6P8W9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hmgb4Q6P8W9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Hmgb4Q6P8W9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hmgb4Q6P8W9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hmgb4Q6P8W9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Hmgb4Q6P8W9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hmgb4Q6P8W9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hmgb4Q6P8W9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hmgb4Q6P8W9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Hmgb4Q6P8W9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hmgb4Q6P8W9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hmgb4Q6P8W9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hmgb4Q6P8W9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hmgb4Q6P8W9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Hmgb4Q6P8W9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hmgb4Q6P8W9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hmgb4Q6P8W9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hmgb4Q6P8W9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hmgb4Q6P8W9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hmgb4Q6P8W9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Hmgb4Q6P8W9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hmgb4Q6P8W9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Hmgb4Q6P8W9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hmgb4Q6P8W9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hmgb4Q6P8W9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hmgb4Q6P8W9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hmgb4Q6P8W9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Hmgb4Q6P8W9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hmgb4Q6P8W9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hmgb4Q6P8W9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hmgb4Q6P8W9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hmgb4Q6P8W9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hmgb4Q6P8W9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hmgb4Q6P8W9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hmgb4Q6P8W9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hmgb4Q6P8W9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hmgb4Q6P8W9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hmgb4Q6P8W9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hmgb4Q6P8W9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hmgb4Q6P8W9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hmgb4Q6P8W9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hmgb4Q6P8W9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hmgb4Q6P8W9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hmgb4Q6P8W9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Hmgb4Q6P8W9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hmgb4Q6P8W9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hmgb4Q6P8W9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hmgb4Q6P8W9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Hmgb4Q6P8W9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hmgb4Q6P8W9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hmgb4Q6P8W9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hmgb4Q6P8W9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hmgb4Q6P8W9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hmgb4Q6P8W9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hmgb4Q6P8W9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Hmgb4Q6P8W9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hmgb4Q6P8W9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hmgb4Q6P8W9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hmgb4Q6P8W9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hmgb4Q6P8W9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Hmgb4Q6P8W9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Hmgb4Q6P8W9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hmgb4Q6P8W9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hmgb4Q6P8W9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hmgb4Q6P8W9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hmgb4Q6P8W9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hmgb4Q6P8W9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hmgb4Q6P8W9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hmgb4Q6P8W9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hmgb4Q6P8W9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hmgb4Q6P8W9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hmgb4Q6P8W9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hmgb4Q6P8W9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hmgb4Q6P8W9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hmgb4Q6P8W9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hmgb4Q6P8W9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hmgb4Q6P8W9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hmgb4Q6P8W9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hmgb4Q6P8W9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hmgb4Q6P8W9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Hmgb4Q6P8W9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hmgb4Q6P8W9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hmgb4Q6P8W9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hmgb4Q6P8W9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hmgb4Q6P8W9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hmgb4Q6P8W9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hmgb4Q6P8W9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hmgb4Q6P8W9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hmgb4Q6P8W9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hmgb4Q6P8W9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hmgb4Q6P8W9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hmgb4Q6P8W9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms