Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5H2

Nes, Nestin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NesQ6P5H2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NesQ6P5H2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NesQ6P5H2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NesQ6P5H2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NesQ6P5H2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NesQ6P5H2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NesQ6P5H2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NesQ6P5H2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NesQ6P5H2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NesQ6P5H2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NesQ6P5H2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NesQ6P5H2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
NesQ6P5H2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NesQ6P5H2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NesQ6P5H2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NesQ6P5H2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NesQ6P5H2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NesQ6P5H2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NesQ6P5H2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
NesQ6P5H2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NesQ6P5H2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NesQ6P5H2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NesQ6P5H2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NesQ6P5H2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NesQ6P5H2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
NesQ6P5H2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NesQ6P5H2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NesQ6P5H2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NesQ6P5H2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NesQ6P5H2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NesQ6P5H2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NesQ6P5H2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
NesQ6P5H2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NesQ6P5H2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
NesQ6P5H2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NesQ6P5H2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NesQ6P5H2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NesQ6P5H2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NesQ6P5H2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NesQ6P5H2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
NesQ6P5H2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
NesQ6P5H2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
NesQ6P5H2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NesQ6P5H2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NesQ6P5H2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NesQ6P5H2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NesQ6P5H2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NesQ6P5H2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NesQ6P5H2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NesQ6P5H2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NesQ6P5H2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NesQ6P5H2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NesQ6P5H2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NesQ6P5H2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NesQ6P5H2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NesQ6P5H2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
NesQ6P5H2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NesQ6P5H2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NesQ6P5H2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NesQ6P5H2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
NesQ6P5H2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NesQ6P5H2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NesQ6P5H2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NesQ6P5H2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NesQ6P5H2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NesQ6P5H2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NesQ6P5H2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NesQ6P5H2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NesQ6P5H2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NesQ6P5H2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NesQ6P5H2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NesQ6P5H2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NesQ6P5H2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NesQ6P5H2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NesQ6P5H2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NesQ6P5H2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NesQ6P5H2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
NesQ6P5H2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NesQ6P5H2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NesQ6P5H2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NesQ6P5H2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NesQ6P5H2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NesQ6P5H2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NesQ6P5H2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NesQ6P5H2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NesQ6P5H2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NesQ6P5H2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NesQ6P5H2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NesQ6P5H2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NesQ6P5H2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NesQ6P5H2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NesQ6P5H2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NesQ6P5H2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NesQ6P5H2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NesQ6P5H2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NesQ6P5H2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NesQ6P5H2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NesQ6P5H2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NesQ6P5H2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NesQ6P5H2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.3 ms