Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atg2aQ6P4T0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atg2aQ6P4T0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atg2aQ6P4T0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atg2aQ6P4T0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atg2aQ6P4T0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Atg2aQ6P4T0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atg2aQ6P4T0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atg2aQ6P4T0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atg2aQ6P4T0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atg2aQ6P4T0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atg2aQ6P4T0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atg2aQ6P4T0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atg2aQ6P4T0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atg2aQ6P4T0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atg2aQ6P4T0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atg2aQ6P4T0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atg2aQ6P4T0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atg2aQ6P4T0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atg2aQ6P4T0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atg2aQ6P4T0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Atg2aQ6P4T0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atg2aQ6P4T0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atg2aQ6P4T0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atg2aQ6P4T0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atg2aQ6P4T0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Atg2aQ6P4T0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atg2aQ6P4T0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atg2aQ6P4T0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atg2aQ6P4T0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Atg2aQ6P4T0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atg2aQ6P4T0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Atg2aQ6P4T0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atg2aQ6P4T0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atg2aQ6P4T0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atg2aQ6P4T0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atg2aQ6P4T0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atg2aQ6P4T0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atg2aQ6P4T0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atg2aQ6P4T0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atg2aQ6P4T0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atg2aQ6P4T0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Atg2aQ6P4T0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Atg2aQ6P4T0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Atg2aQ6P4T0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atg2aQ6P4T0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atg2aQ6P4T0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atg2aQ6P4T0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atg2aQ6P4T0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atg2aQ6P4T0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
Atg2aQ6P4T0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Atg2aQ6P4T0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atg2aQ6P4T0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atg2aQ6P4T0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atg2aQ6P4T0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atg2aQ6P4T0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atg2aQ6P4T0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atg2aQ6P4T0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atg2aQ6P4T0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atg2aQ6P4T0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Atg2aQ6P4T0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atg2aQ6P4T0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atg2aQ6P4T0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atg2aQ6P4T0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atg2aQ6P4T0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atg2aQ6P4T0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atg2aQ6P4T0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atg2aQ6P4T0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Atg2aQ6P4T0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atg2aQ6P4T0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atg2aQ6P4T0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atg2aQ6P4T0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atg2aQ6P4T0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atg2aQ6P4T0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atg2aQ6P4T0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg2aQ6P4T0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg2aQ6P4T0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg2aQ6P4T0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atg2aQ6P4T0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atg2aQ6P4T0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atg2aQ6P4T0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atg2aQ6P4T0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atg2aQ6P4T0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atg2aQ6P4T0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atg2aQ6P4T0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atg2aQ6P4T0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atg2aQ6P4T0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atg2aQ6P4T0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atg2aQ6P4T0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atg2aQ6P4T0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atg2aQ6P4T0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atg2aQ6P4T0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atg2aQ6P4T0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atg2aQ6P4T0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atg2aQ6P4T0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atg2aQ6P4T0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atg2aQ6P4T0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atg2aQ6P4T0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atg2aQ6P4T0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atg2aQ6P4T0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms