Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Soga3Q6NZL0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Soga3Q6NZL0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Soga3Q6NZL0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Soga3Q6NZL0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Soga3Q6NZL0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Soga3Q6NZL0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Soga3Q6NZL0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Soga3Q6NZL0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Soga3Q6NZL0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Soga3Q6NZL0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
Soga3Q6NZL0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Soga3Q6NZL0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Soga3Q6NZL0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Soga3Q6NZL0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Soga3Q6NZL0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Soga3Q6NZL0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Soga3Q6NZL0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Soga3Q6NZL0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Soga3Q6NZL0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Soga3Q6NZL0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Soga3Q6NZL0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Soga3Q6NZL0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Soga3Q6NZL0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Soga3Q6NZL0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Soga3Q6NZL0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Soga3Q6NZL0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Soga3Q6NZL0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Soga3Q6NZL0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Soga3Q6NZL0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Soga3Q6NZL0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Soga3Q6NZL0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Soga3Q6NZL0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Soga3Q6NZL0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Soga3Q6NZL0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Soga3Q6NZL0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Soga3Q6NZL0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Soga3Q6NZL0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Soga3Q6NZL0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Soga3Q6NZL0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Soga3Q6NZL0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Soga3Q6NZL0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Soga3Q6NZL0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Soga3Q6NZL0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Soga3Q6NZL0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Soga3Q6NZL0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Soga3Q6NZL0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Soga3Q6NZL0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Soga3Q6NZL0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Soga3Q6NZL0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Soga3Q6NZL0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Soga3Q6NZL0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Soga3Q6NZL0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Soga3Q6NZL0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Soga3Q6NZL0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Soga3Q6NZL0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Soga3Q6NZL0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Soga3Q6NZL0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Soga3Q6NZL0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Soga3Q6NZL0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Soga3Q6NZL0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Soga3Q6NZL0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Soga3Q6NZL0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Soga3Q6NZL0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Soga3Q6NZL0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Soga3Q6NZL0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Soga3Q6NZL0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Soga3Q6NZL0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Soga3Q6NZL0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Soga3Q6NZL0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Soga3Q6NZL0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Soga3Q6NZL0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Soga3Q6NZL0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Soga3Q6NZL0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Soga3Q6NZL0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Soga3Q6NZL0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Soga3Q6NZL0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Soga3Q6NZL0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Soga3Q6NZL0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Soga3Q6NZL0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Soga3Q6NZL0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Soga3Q6NZL0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC30.89■■■□□ 2.53
Soga3Q6NZL0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Soga3Q6NZL0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Soga3Q6NZL0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Soga3Q6NZL0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Soga3Q6NZL0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Soga3Q6NZL0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Soga3Q6NZL0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Soga3Q6NZL0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Soga3Q6NZL0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Soga3Q6NZL0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Soga3Q6NZL0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Soga3Q6NZL0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Soga3Q6NZL0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Soga3Q6NZL0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Soga3Q6NZL0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Soga3Q6NZL0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Soga3Q6NZL0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Soga3Q6NZL0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms