Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Rprd2Q6NXI6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
Rprd2Q6NXI6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Rprd2Q6NXI6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Rprd2Q6NXI6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Rprd2Q6NXI6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Rprd2Q6NXI6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Rprd2Q6NXI6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Rprd2Q6NXI6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
Rprd2Q6NXI6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
Rprd2Q6NXI6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Rprd2Q6NXI6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Rprd2Q6NXI6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Rprd2Q6NXI6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Rprd2Q6NXI6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Rprd2Q6NXI6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Rprd2Q6NXI6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Rprd2Q6NXI6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Rprd2Q6NXI6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Rprd2Q6NXI6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Rprd2Q6NXI6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Rprd2Q6NXI6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Rprd2Q6NXI6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Rprd2Q6NXI6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Rprd2Q6NXI6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Rprd2Q6NXI6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Rprd2Q6NXI6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Rprd2Q6NXI6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Rprd2Q6NXI6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Rprd2Q6NXI6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
Rprd2Q6NXI6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Rprd2Q6NXI6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Rprd2Q6NXI6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Rprd2Q6NXI6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
Rprd2Q6NXI6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Rprd2Q6NXI6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
Rprd2Q6NXI6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Rprd2Q6NXI6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
Rprd2Q6NXI6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Rprd2Q6NXI6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Rprd2Q6NXI6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Rprd2Q6NXI6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Rprd2Q6NXI6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Rprd2Q6NXI6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Rprd2Q6NXI6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Rprd2Q6NXI6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Rprd2Q6NXI6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Rprd2Q6NXI6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Rprd2Q6NXI6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Rprd2Q6NXI6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Rprd2Q6NXI6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Rprd2Q6NXI6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
Rprd2Q6NXI6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Rprd2Q6NXI6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Rprd2Q6NXI6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Rprd2Q6NXI6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Rprd2Q6NXI6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Rprd2Q6NXI6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Rprd2Q6NXI6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Rprd2Q6NXI6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
Rprd2Q6NXI6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Rprd2Q6NXI6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Rprd2Q6NXI6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Rprd2Q6NXI6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Rprd2Q6NXI6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Rprd2Q6NXI6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Rprd2Q6NXI6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Rprd2Q6NXI6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
Rprd2Q6NXI6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Rprd2Q6NXI6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Rprd2Q6NXI6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Rprd2Q6NXI6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Rprd2Q6NXI6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Rprd2Q6NXI6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Rprd2Q6NXI6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Rprd2Q6NXI6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Rprd2Q6NXI6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Rprd2Q6NXI6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Rprd2Q6NXI6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Rprd2Q6NXI6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Rprd2Q6NXI6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Rprd2Q6NXI6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Rprd2Q6NXI6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Rprd2Q6NXI6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Rprd2Q6NXI6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
Rprd2Q6NXI6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Rprd2Q6NXI6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Rprd2Q6NXI6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Rprd2Q6NXI6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Rprd2Q6NXI6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Rprd2Q6NXI6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Rprd2Q6NXI6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Rprd2Q6NXI6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Rprd2Q6NXI6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Rprd2Q6NXI6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Rprd2Q6NXI6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Rprd2Q6NXI6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Rprd2Q6NXI6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Rprd2Q6NXI6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Rprd2Q6NXI6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms