Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,05■■■■□ 3,36
Sall3Q62255 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,02■■■■□ 3,36
Sall3Q62255 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,02■■■■□ 3,36
Sall3Q62255 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3,35
Sall3Q62255 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3,35
Sall3Q62255 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC35,97■■■■□ 3,35
Sall3Q62255 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC35,97■■■■□ 3,35
Sall3Q62255 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC35,96■■■■□ 3,35
Sall3Q62255 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC35,93■■■■□ 3,34
Sall3Q62255 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,92■■■■□ 3,34
Sall3Q62255 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC35,92■■■■□ 3,34
Sall3Q62255 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,91■■■■□ 3,34
Sall3Q62255 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC35,91■■■■□ 3,34
Sall3Q62255 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC35,9■■■■□ 3,34
Sall3Q62255 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,89■■■■□ 3,34
Sall3Q62255 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,88■■■■□ 3,33
Sall3Q62255 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC35,88■■■■□ 3,33
Sall3Q62255 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC35,87■■■■□ 3,33
Sall3Q62255 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,87■■■■□ 3,33
Sall3Q62255 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,86■■■■□ 3,33
Sall3Q62255 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC35,86■■■■□ 3,33
Sall3Q62255 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC35,85■■■■□ 3,33
Sall3Q62255 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35,84■■■■□ 3,33
Sall3Q62255 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC35,83■■■■□ 3,33
Sall3Q62255 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC35,83■■■■□ 3,33
Sall3Q62255 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,83■■■■□ 3,33
Sall3Q62255 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,82■■■■□ 3,32
Sall3Q62255 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,81■■■■□ 3,32
Sall3Q62255 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC35,8■■■■□ 3,32
Sall3Q62255 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,78■■■■□ 3,32
Sall3Q62255 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC35,77■■■■□ 3,32
Sall3Q62255 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,77■■■■□ 3,32
Sall3Q62255 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,75■■■■□ 3,31
Sall3Q62255 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC35,75■■■■□ 3,31
Sall3Q62255 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC35,74■■■■□ 3,31
Sall3Q62255 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC35,74■■■■□ 3,31
Sall3Q62255 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,74■■■■□ 3,31
Sall3Q62255 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,73■■■■□ 3,31
Sall3Q62255 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,72■■■■□ 3,31
Sall3Q62255 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,72■■■■□ 3,31
Sall3Q62255 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35,72■■■■□ 3,31
Sall3Q62255 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,72■■■■□ 3,31
Sall3Q62255 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC35,71■■■■□ 3,31
Sall3Q62255 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,7■■■■□ 3,31
Sall3Q62255 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC35,7■■■■□ 3,31
Sall3Q62255 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,69■■■■□ 3,3
Sall3Q62255 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,68■■■■□ 3,3
Sall3Q62255 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,67■■■■□ 3,3
Sall3Q62255 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,65■■■■□ 3,3
Sall3Q62255 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35,62■■■■□ 3,29
Sall3Q62255 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,62■■■■□ 3,29
Sall3Q62255 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC35,62■■■■□ 3,29
Sall3Q62255 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35,61■■■■□ 3,29
Sall3Q62255 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC35,61■■■■□ 3,29
Sall3Q62255 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC35,59■■■■□ 3,29
Sall3Q62255 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC35,59■■■■□ 3,29
Sall3Q62255 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC35,59■■■■□ 3,29
Sall3Q62255 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC35,58■■■■□ 3,29
Sall3Q62255 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC35,58■■■■□ 3,29
Sall3Q62255 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,57■■■■□ 3,28
Sall3Q62255 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC35,57■■■■□ 3,28
Sall3Q62255 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35,56■■■■□ 3,28
Sall3Q62255 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,56■■■■□ 3,28
Sall3Q62255 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC35,55■■■■□ 3,28
Sall3Q62255 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,52■■■■□ 3,28
Sall3Q62255 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC35,51■■■■□ 3,27
Sall3Q62255 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,48■■■■□ 3,27
Sall3Q62255 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,48■■■■□ 3,27
Sall3Q62255 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,46■■■■□ 3,27
Sall3Q62255 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC35,44■■■■□ 3,26
Sall3Q62255 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35,43■■■■□ 3,26
Sall3Q62255 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC35,43■■■■□ 3,26
Sall3Q62255 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35,42■■■■□ 3,26
Sall3Q62255 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,42■■■■□ 3,26
Sall3Q62255 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35,41■■■■□ 3,26
Sall3Q62255 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,41■■■■□ 3,26
Sall3Q62255 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,4■■■■□ 3,26
Sall3Q62255 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC35,38■■■■□ 3,25
Sall3Q62255 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35,38■■■■□ 3,25
Sall3Q62255 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC35,37■■■■□ 3,25
Sall3Q62255 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,37■■■■□ 3,25
Sall3Q62255 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,37■■■■□ 3,25
Sall3Q62255 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,37■■■■□ 3,25
Sall3Q62255 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35,36■■■■□ 3,25
Sall3Q62255 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,34■■■■□ 3,25
Sall3Q62255 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC35,33■■■■□ 3,25
Sall3Q62255 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC35,32■■■■□ 3,25
Sall3Q62255 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,24
Sall3Q62255 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,32■■■■□ 3,24
Sall3Q62255 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC35,32■■■■□ 3,24
Sall3Q62255 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,29■■■■□ 3,24
Sall3Q62255 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,28■■■■□ 3,24
Sall3Q62255 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,26■■■■□ 3,23
Sall3Q62255 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC35,25■■■■□ 3,23
Sall3Q62255 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC35,25■■■■□ 3,23
Sall3Q62255 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,24■■■■□ 3,23
Sall3Q62255 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC35,24■■■■□ 3,23
Sall3Q62255 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC35,22■■■■□ 3,23
Sall3Q62255 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC35,22■■■■□ 3,23
Sall3Q62255 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC35,2■■■■□ 3,23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms