Protein–RNA interactions for Protein: Q62059

Vcan, Versican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcanQ62059 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VcanQ62059 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VcanQ62059 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VcanQ62059 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VcanQ62059 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VcanQ62059 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VcanQ62059 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VcanQ62059 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VcanQ62059 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VcanQ62059 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VcanQ62059 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
VcanQ62059 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VcanQ62059 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VcanQ62059 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VcanQ62059 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VcanQ62059 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VcanQ62059 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VcanQ62059 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VcanQ62059 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VcanQ62059 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VcanQ62059 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VcanQ62059 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VcanQ62059 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VcanQ62059 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VcanQ62059 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VcanQ62059 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VcanQ62059 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VcanQ62059 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VcanQ62059 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
VcanQ62059 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VcanQ62059 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VcanQ62059 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VcanQ62059 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VcanQ62059 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VcanQ62059 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VcanQ62059 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VcanQ62059 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VcanQ62059 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VcanQ62059 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VcanQ62059 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VcanQ62059 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VcanQ62059 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VcanQ62059 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VcanQ62059 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VcanQ62059 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VcanQ62059 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VcanQ62059 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VcanQ62059 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VcanQ62059 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VcanQ62059 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VcanQ62059 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VcanQ62059 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VcanQ62059 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VcanQ62059 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VcanQ62059 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VcanQ62059 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VcanQ62059 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VcanQ62059 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VcanQ62059 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
VcanQ62059 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
VcanQ62059 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
VcanQ62059 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VcanQ62059 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VcanQ62059 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VcanQ62059 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VcanQ62059 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VcanQ62059 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VcanQ62059 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VcanQ62059 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VcanQ62059 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VcanQ62059 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VcanQ62059 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VcanQ62059 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VcanQ62059 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VcanQ62059 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VcanQ62059 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VcanQ62059 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VcanQ62059 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VcanQ62059 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VcanQ62059 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
VcanQ62059 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VcanQ62059 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VcanQ62059 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VcanQ62059 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VcanQ62059 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VcanQ62059 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VcanQ62059 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VcanQ62059 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VcanQ62059 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VcanQ62059 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VcanQ62059 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VcanQ62059 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VcanQ62059 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VcanQ62059 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VcanQ62059 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VcanQ62059 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VcanQ62059 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VcanQ62059 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VcanQ62059 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VcanQ62059 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1090.5 ms