Protein–RNA interactions for Protein: Q61810

Ltbp3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp3Q61810 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ltbp3Q61810 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ltbp3Q61810 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ltbp3Q61810 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ltbp3Q61810 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ltbp3Q61810 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ltbp3Q61810 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ltbp3Q61810 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ltbp3Q61810 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ltbp3Q61810 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ltbp3Q61810 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ltbp3Q61810 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ltbp3Q61810 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ltbp3Q61810 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ltbp3Q61810 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ltbp3Q61810 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ltbp3Q61810 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ltbp3Q61810 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ltbp3Q61810 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ltbp3Q61810 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ltbp3Q61810 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Ltbp3Q61810 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ltbp3Q61810 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ltbp3Q61810 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ltbp3Q61810 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ltbp3Q61810 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ltbp3Q61810 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ltbp3Q61810 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ltbp3Q61810 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ltbp3Q61810 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ltbp3Q61810 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ltbp3Q61810 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ltbp3Q61810 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ltbp3Q61810 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ltbp3Q61810 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ltbp3Q61810 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ltbp3Q61810 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ltbp3Q61810 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ltbp3Q61810 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ltbp3Q61810 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ltbp3Q61810 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ltbp3Q61810 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ltbp3Q61810 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ltbp3Q61810 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ltbp3Q61810 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ltbp3Q61810 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ltbp3Q61810 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ltbp3Q61810 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ltbp3Q61810 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ltbp3Q61810 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ltbp3Q61810 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ltbp3Q61810 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ltbp3Q61810 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ltbp3Q61810 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ltbp3Q61810 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ltbp3Q61810 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ltbp3Q61810 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ltbp3Q61810 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ltbp3Q61810 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ltbp3Q61810 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ltbp3Q61810 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ltbp3Q61810 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ltbp3Q61810 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ltbp3Q61810 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ltbp3Q61810 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ltbp3Q61810 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ltbp3Q61810 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ltbp3Q61810 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ltbp3Q61810 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ltbp3Q61810 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ltbp3Q61810 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ltbp3Q61810 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ltbp3Q61810 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ltbp3Q61810 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ltbp3Q61810 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ltbp3Q61810 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ltbp3Q61810 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ltbp3Q61810 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ltbp3Q61810 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.72
Ltbp3Q61810 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ltbp3Q61810 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ltbp3Q61810 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ltbp3Q61810 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ltbp3Q61810 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ltbp3Q61810 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ltbp3Q61810 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ltbp3Q61810 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ltbp3Q61810 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ltbp3Q61810 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ltbp3Q61810 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ltbp3Q61810 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ltbp3Q61810 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ltbp3Q61810 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ltbp3Q61810 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ltbp3Q61810 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ltbp3Q61810 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ltbp3Q61810 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ltbp3Q61810 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ltbp3Q61810 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ltbp3Q61810 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.9 ms