Protein–RNA interactions for Protein: Q61473

Sox17, Transcription factor SOX-17, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox17Q61473 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sox17Q61473 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sox17Q61473 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sox17Q61473 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sox17Q61473 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sox17Q61473 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox17Q61473 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox17Q61473 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox17Q61473 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sox17Q61473 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sox17Q61473 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sox17Q61473 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sox17Q61473 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sox17Q61473 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sox17Q61473 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox17Q61473 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox17Q61473 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sox17Q61473 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sox17Q61473 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox17Q61473 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sox17Q61473 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sox17Q61473 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sox17Q61473 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox17Q61473 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sox17Q61473 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sox17Q61473 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sox17Q61473 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sox17Q61473 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sox17Q61473 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sox17Q61473 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sox17Q61473 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sox17Q61473 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sox17Q61473 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox17Q61473 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox17Q61473 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox17Q61473 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox17Q61473 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox17Q61473 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox17Q61473 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sox17Q61473 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox17Q61473 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox17Q61473 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox17Q61473 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox17Q61473 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox17Q61473 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sox17Q61473 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Sox17Q61473 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sox17Q61473 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Sox17Q61473 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sox17Q61473 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sox17Q61473 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sox17Q61473 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Sox17Q61473 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sox17Q61473 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sox17Q61473 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sox17Q61473 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sox17Q61473 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox17Q61473 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox17Q61473 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox17Q61473 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox17Q61473 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox17Q61473 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox17Q61473 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox17Q61473 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox17Q61473 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sox17Q61473 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox17Q61473 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox17Q61473 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox17Q61473 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox17Q61473 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox17Q61473 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox17Q61473 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox17Q61473 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox17Q61473 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox17Q61473 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox17Q61473 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sox17Q61473 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox17Q61473 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox17Q61473 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox17Q61473 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox17Q61473 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox17Q61473 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox17Q61473 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox17Q61473 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox17Q61473 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox17Q61473 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox17Q61473 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox17Q61473 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox17Q61473 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox17Q61473 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox17Q61473 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox17Q61473 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox17Q61473 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox17Q61473 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox17Q61473 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox17Q61473 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox17Q61473 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox17Q61473 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox17Q61473 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox17Q61473 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms