Protein–RNA interactions for Protein: Q61330

Cntn2, Contactin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn2Q61330 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cntn2Q61330 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Cntn2Q61330 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cntn2Q61330 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cntn2Q61330 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cntn2Q61330 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cntn2Q61330 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cntn2Q61330 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cntn2Q61330 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cntn2Q61330 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cntn2Q61330 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cntn2Q61330 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cntn2Q61330 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cntn2Q61330 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Cntn2Q61330 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cntn2Q61330 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cntn2Q61330 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cntn2Q61330 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cntn2Q61330 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cntn2Q61330 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cntn2Q61330 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cntn2Q61330 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cntn2Q61330 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cntn2Q61330 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cntn2Q61330 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cntn2Q61330 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cntn2Q61330 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cntn2Q61330 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cntn2Q61330 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Cntn2Q61330 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cntn2Q61330 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cntn2Q61330 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cntn2Q61330 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cntn2Q61330 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Cntn2Q61330 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cntn2Q61330 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cntn2Q61330 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cntn2Q61330 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Cntn2Q61330 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cntn2Q61330 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cntn2Q61330 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cntn2Q61330 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cntn2Q61330 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cntn2Q61330 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cntn2Q61330 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cntn2Q61330 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cntn2Q61330 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Cntn2Q61330 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Cntn2Q61330 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cntn2Q61330 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cntn2Q61330 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cntn2Q61330 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cntn2Q61330 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cntn2Q61330 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cntn2Q61330 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cntn2Q61330 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cntn2Q61330 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cntn2Q61330 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cntn2Q61330 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cntn2Q61330 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cntn2Q61330 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cntn2Q61330 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cntn2Q61330 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cntn2Q61330 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Cntn2Q61330 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cntn2Q61330 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cntn2Q61330 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cntn2Q61330 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cntn2Q61330 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cntn2Q61330 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cntn2Q61330 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cntn2Q61330 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cntn2Q61330 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cntn2Q61330 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Cntn2Q61330 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cntn2Q61330 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cntn2Q61330 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cntn2Q61330 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cntn2Q61330 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Cntn2Q61330 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cntn2Q61330 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cntn2Q61330 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cntn2Q61330 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cntn2Q61330 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cntn2Q61330 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Cntn2Q61330 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cntn2Q61330 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cntn2Q61330 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cntn2Q61330 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cntn2Q61330 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cntn2Q61330 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cntn2Q61330 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cntn2Q61330 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cntn2Q61330 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cntn2Q61330 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cntn2Q61330 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cntn2Q61330 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cntn2Q61330 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cntn2Q61330 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cntn2Q61330 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.3 ms