Protein–RNA interactions for Protein: Q61235

Sntb2, Beta-2-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntb2Q61235 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sntb2Q61235 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sntb2Q61235 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sntb2Q61235 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sntb2Q61235 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sntb2Q61235 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sntb2Q61235 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sntb2Q61235 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sntb2Q61235 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sntb2Q61235 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sntb2Q61235 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sntb2Q61235 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sntb2Q61235 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sntb2Q61235 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sntb2Q61235 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sntb2Q61235 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sntb2Q61235 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sntb2Q61235 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sntb2Q61235 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sntb2Q61235 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sntb2Q61235 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sntb2Q61235 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sntb2Q61235 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sntb2Q61235 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sntb2Q61235 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sntb2Q61235 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sntb2Q61235 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sntb2Q61235 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sntb2Q61235 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sntb2Q61235 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sntb2Q61235 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sntb2Q61235 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sntb2Q61235 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sntb2Q61235 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sntb2Q61235 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sntb2Q61235 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sntb2Q61235 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sntb2Q61235 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sntb2Q61235 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sntb2Q61235 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sntb2Q61235 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sntb2Q61235 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sntb2Q61235 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sntb2Q61235 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sntb2Q61235 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sntb2Q61235 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sntb2Q61235 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sntb2Q61235 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sntb2Q61235 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sntb2Q61235 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sntb2Q61235 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sntb2Q61235 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sntb2Q61235 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sntb2Q61235 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sntb2Q61235 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sntb2Q61235 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sntb2Q61235 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sntb2Q61235 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Sntb2Q61235 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sntb2Q61235 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sntb2Q61235 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sntb2Q61235 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sntb2Q61235 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sntb2Q61235 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sntb2Q61235 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sntb2Q61235 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Sntb2Q61235 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sntb2Q61235 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sntb2Q61235 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sntb2Q61235 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sntb2Q61235 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Sntb2Q61235 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sntb2Q61235 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sntb2Q61235 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sntb2Q61235 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sntb2Q61235 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sntb2Q61235 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sntb2Q61235 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sntb2Q61235 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sntb2Q61235 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sntb2Q61235 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sntb2Q61235 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sntb2Q61235 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sntb2Q61235 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sntb2Q61235 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sntb2Q61235 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sntb2Q61235 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sntb2Q61235 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sntb2Q61235 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sntb2Q61235 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sntb2Q61235 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sntb2Q61235 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Sntb2Q61235 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sntb2Q61235 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sntb2Q61235 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Sntb2Q61235 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sntb2Q61235 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sntb2Q61235 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sntb2Q61235 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sntb2Q61235 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms