Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW75

Ssh2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh2Q5SW75 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Ssh2Q5SW75 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Ssh2Q5SW75 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
Ssh2Q5SW75 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Ssh2Q5SW75 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Ssh2Q5SW75 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Ssh2Q5SW75 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Ssh2Q5SW75 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Ssh2Q5SW75 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Ssh2Q5SW75 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Ssh2Q5SW75 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Ssh2Q5SW75 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Ssh2Q5SW75 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Ssh2Q5SW75 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Ssh2Q5SW75 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Ssh2Q5SW75 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Ssh2Q5SW75 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
Ssh2Q5SW75 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Ssh2Q5SW75 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Ssh2Q5SW75 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Ssh2Q5SW75 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Ssh2Q5SW75 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Ssh2Q5SW75 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Ssh2Q5SW75 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Ssh2Q5SW75 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
Ssh2Q5SW75 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Ssh2Q5SW75 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Ssh2Q5SW75 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Ssh2Q5SW75 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Ssh2Q5SW75 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Ssh2Q5SW75 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Ssh2Q5SW75 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Ssh2Q5SW75 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Ssh2Q5SW75 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Ssh2Q5SW75 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Ssh2Q5SW75 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
Ssh2Q5SW75 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Ssh2Q5SW75 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Ssh2Q5SW75 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Ssh2Q5SW75 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
Ssh2Q5SW75 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Ssh2Q5SW75 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Ssh2Q5SW75 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Ssh2Q5SW75 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Ssh2Q5SW75 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Ssh2Q5SW75 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Ssh2Q5SW75 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Ssh2Q5SW75 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Ssh2Q5SW75 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Ssh2Q5SW75 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Ssh2Q5SW75 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Ssh2Q5SW75 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Ssh2Q5SW75 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Ssh2Q5SW75 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Ssh2Q5SW75 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Ssh2Q5SW75 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
Ssh2Q5SW75 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Ssh2Q5SW75 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Ssh2Q5SW75 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Ssh2Q5SW75 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Ssh2Q5SW75 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Ssh2Q5SW75 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Ssh2Q5SW75 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Ssh2Q5SW75 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Ssh2Q5SW75 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Ssh2Q5SW75 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ssh2Q5SW75 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ssh2Q5SW75 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Ssh2Q5SW75 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Ssh2Q5SW75 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Ssh2Q5SW75 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Ssh2Q5SW75 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Ssh2Q5SW75 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Ssh2Q5SW75 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Ssh2Q5SW75 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Ssh2Q5SW75 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Ssh2Q5SW75 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Ssh2Q5SW75 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Ssh2Q5SW75 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Ssh2Q5SW75 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Ssh2Q5SW75 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Ssh2Q5SW75 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
Ssh2Q5SW75 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Ssh2Q5SW75 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Ssh2Q5SW75 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Ssh2Q5SW75 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Ssh2Q5SW75 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Ssh2Q5SW75 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Ssh2Q5SW75 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Ssh2Q5SW75 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Ssh2Q5SW75 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Ssh2Q5SW75 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ssh2Q5SW75 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ssh2Q5SW75 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Ssh2Q5SW75 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Ssh2Q5SW75 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Ssh2Q5SW75 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Ssh2Q5SW75 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Ssh2Q5SW75 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Ssh2Q5SW75 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms