Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW45

Mks1, Meckel syndrome type 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mks1Q5SW45 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mks1Q5SW45 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mks1Q5SW45 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Mks1Q5SW45 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mks1Q5SW45 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mks1Q5SW45 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mks1Q5SW45 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Mks1Q5SW45 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mks1Q5SW45 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mks1Q5SW45 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mks1Q5SW45 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mks1Q5SW45 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mks1Q5SW45 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mks1Q5SW45 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mks1Q5SW45 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mks1Q5SW45 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mks1Q5SW45 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mks1Q5SW45 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mks1Q5SW45 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mks1Q5SW45 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Mks1Q5SW45 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mks1Q5SW45 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mks1Q5SW45 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mks1Q5SW45 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mks1Q5SW45 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mks1Q5SW45 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mks1Q5SW45 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mks1Q5SW45 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Mks1Q5SW45 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Mks1Q5SW45 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mks1Q5SW45 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mks1Q5SW45 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mks1Q5SW45 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mks1Q5SW45 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Mks1Q5SW45 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mks1Q5SW45 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mks1Q5SW45 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mks1Q5SW45 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mks1Q5SW45 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mks1Q5SW45 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mks1Q5SW45 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mks1Q5SW45 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mks1Q5SW45 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mks1Q5SW45 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mks1Q5SW45 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mks1Q5SW45 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mks1Q5SW45 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mks1Q5SW45 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Mks1Q5SW45 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mks1Q5SW45 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Mks1Q5SW45 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mks1Q5SW45 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mks1Q5SW45 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mks1Q5SW45 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mks1Q5SW45 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mks1Q5SW45 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mks1Q5SW45 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mks1Q5SW45 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mks1Q5SW45 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mks1Q5SW45 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mks1Q5SW45 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mks1Q5SW45 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mks1Q5SW45 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mks1Q5SW45 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mks1Q5SW45 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mks1Q5SW45 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mks1Q5SW45 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mks1Q5SW45 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mks1Q5SW45 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mks1Q5SW45 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mks1Q5SW45 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Mks1Q5SW45 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mks1Q5SW45 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mks1Q5SW45 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mks1Q5SW45 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mks1Q5SW45 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mks1Q5SW45 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mks1Q5SW45 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mks1Q5SW45 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mks1Q5SW45 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mks1Q5SW45 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mks1Q5SW45 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mks1Q5SW45 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mks1Q5SW45 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mks1Q5SW45 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mks1Q5SW45 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mks1Q5SW45 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mks1Q5SW45 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mks1Q5SW45 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mks1Q5SW45 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mks1Q5SW45 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mks1Q5SW45 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mks1Q5SW45 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mks1Q5SW45 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mks1Q5SW45 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mks1Q5SW45 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mks1Q5SW45 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mks1Q5SW45 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mks1Q5SW45 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mks1Q5SW45 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms